Protein–RNA interactions for Protein: A0A140LIT1

Ccdc194, Coiled-coil domain-containing protein 194, mousemouse

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Length 234 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc194A0A140LIT1 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
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Ccdc194A0A140LIT1 Dysf-214ENSMUST00000204354 6432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc194A0A140LIT1 Sptb-201ENSMUST00000021458 10394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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Ccdc194A0A140LIT1 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc194A0A140LIT1 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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Ccdc194A0A140LIT1 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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Ccdc194A0A140LIT1 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ccdc194A0A140LIT1 Galnt4-201ENSMUST00000161240 5089 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
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Ccdc194A0A140LIT1 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
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Ccdc194A0A140LIT1 Phka1-202ENSMUST00000052012 6115 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ccdc194A0A140LIT1 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ccdc194A0A140LIT1 Otud4-203ENSMUST00000173286 7213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ccdc194A0A140LIT1 Rbl2-208ENSMUST00000209518 4792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ccdc194A0A140LIT1 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ccdc194A0A140LIT1 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ccdc194A0A140LIT1 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ccdc194A0A140LIT1 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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Ccdc194A0A140LIT1 Yes1-201ENSMUST00000072311 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
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Ccdc194A0A140LIT1 Sall3-201ENSMUST00000057950 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ccdc194A0A140LIT1 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ccdc194A0A140LIT1 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ccdc194A0A140LIT1 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
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