Protein–RNA interactions for Protein: T1NXB5

Vstm4, V-set and transmembrane domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vstm4T1NXB5 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Vstm4T1NXB5 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Vstm4T1NXB5 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Vstm4T1NXB5 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Vstm4T1NXB5 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Vstm4T1NXB5 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Vstm4T1NXB5 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Vstm4T1NXB5 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
Vstm4T1NXB5 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Vstm4T1NXB5 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Vstm4T1NXB5 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Vstm4T1NXB5 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Vstm4T1NXB5 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Vstm4T1NXB5 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Vstm4T1NXB5 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Vstm4T1NXB5 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Vstm4T1NXB5 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Vstm4T1NXB5 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Vstm4T1NXB5 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Vstm4T1NXB5 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Vstm4T1NXB5 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Vstm4T1NXB5 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Vstm4T1NXB5 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Vstm4T1NXB5 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Vstm4T1NXB5 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Vstm4T1NXB5 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Vstm4T1NXB5 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Vstm4T1NXB5 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Vstm4T1NXB5 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Vstm4T1NXB5 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Vstm4T1NXB5 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Vstm4T1NXB5 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Vstm4T1NXB5 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Vstm4T1NXB5 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Vstm4T1NXB5 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Vstm4T1NXB5 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Vstm4T1NXB5 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
Vstm4T1NXB5 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Vstm4T1NXB5 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Vstm4T1NXB5 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
Vstm4T1NXB5 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Vstm4T1NXB5 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Vstm4T1NXB5 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Vstm4T1NXB5 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
Vstm4T1NXB5 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Vstm4T1NXB5 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Vstm4T1NXB5 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Vstm4T1NXB5 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Vstm4T1NXB5 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Vstm4T1NXB5 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Vstm4T1NXB5 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Vstm4T1NXB5 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Vstm4T1NXB5 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Vstm4T1NXB5 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Vstm4T1NXB5 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Vstm4T1NXB5 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Vstm4T1NXB5 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Vstm4T1NXB5 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
Vstm4T1NXB5 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Vstm4T1NXB5 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Vstm4T1NXB5 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
Vstm4T1NXB5 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Vstm4T1NXB5 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Vstm4T1NXB5 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Vstm4T1NXB5 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Vstm4T1NXB5 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Vstm4T1NXB5 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Vstm4T1NXB5 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
Vstm4T1NXB5 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Vstm4T1NXB5 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Vstm4T1NXB5 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Vstm4T1NXB5 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Vstm4T1NXB5 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Vstm4T1NXB5 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Vstm4T1NXB5 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Vstm4T1NXB5 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Vstm4T1NXB5 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Vstm4T1NXB5 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Vstm4T1NXB5 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Vstm4T1NXB5 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Vstm4T1NXB5 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Vstm4T1NXB5 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Vstm4T1NXB5 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
Vstm4T1NXB5 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
Vstm4T1NXB5 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
Vstm4T1NXB5 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Vstm4T1NXB5 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Vstm4T1NXB5 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Vstm4T1NXB5 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
Vstm4T1NXB5 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Vstm4T1NXB5 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Vstm4T1NXB5 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Vstm4T1NXB5 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Vstm4T1NXB5 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Vstm4T1NXB5 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Vstm4T1NXB5 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Vstm4T1NXB5 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Vstm4T1NXB5 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Vstm4T1NXB5 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Vstm4T1NXB5 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 80.2 ms