Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2T6

Krt85, Keratin, type II cuticular Hb5, mousemouse

Predictions only

Length 507 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt85Q9Z2T6 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Krt85Q9Z2T6 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
Krt85Q9Z2T6 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Krt85Q9Z2T6 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Krt85Q9Z2T6 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Krt85Q9Z2T6 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Krt85Q9Z2T6 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Krt85Q9Z2T6 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Krt85Q9Z2T6 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Krt85Q9Z2T6 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Krt85Q9Z2T6 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Krt85Q9Z2T6 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Krt85Q9Z2T6 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Krt85Q9Z2T6 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Krt85Q9Z2T6 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Krt85Q9Z2T6 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Krt85Q9Z2T6 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
Krt85Q9Z2T6 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Krt85Q9Z2T6 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Krt85Q9Z2T6 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Krt85Q9Z2T6 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
Krt85Q9Z2T6 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Krt85Q9Z2T6 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Krt85Q9Z2T6 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Krt85Q9Z2T6 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Krt85Q9Z2T6 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Krt85Q9Z2T6 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Krt85Q9Z2T6 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Krt85Q9Z2T6 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
Krt85Q9Z2T6 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Krt85Q9Z2T6 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Krt85Q9Z2T6 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Krt85Q9Z2T6 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Krt85Q9Z2T6 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
Krt85Q9Z2T6 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Krt85Q9Z2T6 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Krt85Q9Z2T6 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Krt85Q9Z2T6 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Krt85Q9Z2T6 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Krt85Q9Z2T6 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Krt85Q9Z2T6 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Krt85Q9Z2T6 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Krt85Q9Z2T6 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Krt85Q9Z2T6 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Krt85Q9Z2T6 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Krt85Q9Z2T6 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Krt85Q9Z2T6 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Krt85Q9Z2T6 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Krt85Q9Z2T6 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Krt85Q9Z2T6 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Krt85Q9Z2T6 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Krt85Q9Z2T6 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Krt85Q9Z2T6 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Krt85Q9Z2T6 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Krt85Q9Z2T6 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Krt85Q9Z2T6 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Krt85Q9Z2T6 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Krt85Q9Z2T6 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
Krt85Q9Z2T6 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Krt85Q9Z2T6 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Krt85Q9Z2T6 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
Krt85Q9Z2T6 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Krt85Q9Z2T6 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Krt85Q9Z2T6 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Krt85Q9Z2T6 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Krt85Q9Z2T6 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
Krt85Q9Z2T6 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Krt85Q9Z2T6 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Krt85Q9Z2T6 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
Krt85Q9Z2T6 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Krt85Q9Z2T6 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Krt85Q9Z2T6 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Krt85Q9Z2T6 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Krt85Q9Z2T6 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Krt85Q9Z2T6 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Krt85Q9Z2T6 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Krt85Q9Z2T6 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Krt85Q9Z2T6 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Krt85Q9Z2T6 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Krt85Q9Z2T6 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Krt85Q9Z2T6 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Krt85Q9Z2T6 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Krt85Q9Z2T6 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Krt85Q9Z2T6 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Krt85Q9Z2T6 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Krt85Q9Z2T6 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Krt85Q9Z2T6 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Krt85Q9Z2T6 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
Krt85Q9Z2T6 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Krt85Q9Z2T6 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Krt85Q9Z2T6 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
Krt85Q9Z2T6 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Krt85Q9Z2T6 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
Krt85Q9Z2T6 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Krt85Q9Z2T6 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Krt85Q9Z2T6 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Krt85Q9Z2T6 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
Krt85Q9Z2T6 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Krt85Q9Z2T6 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.64
Krt85Q9Z2T6 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.8 ms