Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1P4

Lgr5, Leucine-rich repeat-containing G-protein coupled receptor 5, mousemouse

Predictions only

Length 907 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lgr5Q9Z1P4 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Lgr5Q9Z1P4 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Lgr5Q9Z1P4 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
Lgr5Q9Z1P4 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Lgr5Q9Z1P4 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Lgr5Q9Z1P4 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
Lgr5Q9Z1P4 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
Lgr5Q9Z1P4 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Lgr5Q9Z1P4 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Lgr5Q9Z1P4 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Lgr5Q9Z1P4 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Lgr5Q9Z1P4 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Lgr5Q9Z1P4 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Lgr5Q9Z1P4 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Lgr5Q9Z1P4 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Lgr5Q9Z1P4 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Lgr5Q9Z1P4 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Lgr5Q9Z1P4 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Lgr5Q9Z1P4 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Lgr5Q9Z1P4 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Lgr5Q9Z1P4 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Lgr5Q9Z1P4 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Lgr5Q9Z1P4 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Lgr5Q9Z1P4 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Lgr5Q9Z1P4 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
Lgr5Q9Z1P4 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Lgr5Q9Z1P4 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Lgr5Q9Z1P4 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Lgr5Q9Z1P4 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Lgr5Q9Z1P4 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Lgr5Q9Z1P4 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Lgr5Q9Z1P4 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Lgr5Q9Z1P4 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Lgr5Q9Z1P4 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Lgr5Q9Z1P4 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Lgr5Q9Z1P4 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Lgr5Q9Z1P4 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Lgr5Q9Z1P4 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Lgr5Q9Z1P4 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Lgr5Q9Z1P4 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Lgr5Q9Z1P4 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Lgr5Q9Z1P4 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Lgr5Q9Z1P4 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Lgr5Q9Z1P4 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Lgr5Q9Z1P4 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Lgr5Q9Z1P4 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Lgr5Q9Z1P4 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Lgr5Q9Z1P4 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Lgr5Q9Z1P4 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Lgr5Q9Z1P4 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Lgr5Q9Z1P4 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
Lgr5Q9Z1P4 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Lgr5Q9Z1P4 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Lgr5Q9Z1P4 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Lgr5Q9Z1P4 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Lgr5Q9Z1P4 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Lgr5Q9Z1P4 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Lgr5Q9Z1P4 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Lgr5Q9Z1P4 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Lgr5Q9Z1P4 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Lgr5Q9Z1P4 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Lgr5Q9Z1P4 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Lgr5Q9Z1P4 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Lgr5Q9Z1P4 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Lgr5Q9Z1P4 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Lgr5Q9Z1P4 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Lgr5Q9Z1P4 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Lgr5Q9Z1P4 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Lgr5Q9Z1P4 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Lgr5Q9Z1P4 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Lgr5Q9Z1P4 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Lgr5Q9Z1P4 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
Lgr5Q9Z1P4 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Lgr5Q9Z1P4 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Lgr5Q9Z1P4 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Lgr5Q9Z1P4 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
Lgr5Q9Z1P4 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Lgr5Q9Z1P4 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Lgr5Q9Z1P4 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Lgr5Q9Z1P4 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Lgr5Q9Z1P4 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Lgr5Q9Z1P4 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Lgr5Q9Z1P4 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Lgr5Q9Z1P4 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Lgr5Q9Z1P4 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Lgr5Q9Z1P4 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Lgr5Q9Z1P4 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Lgr5Q9Z1P4 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Lgr5Q9Z1P4 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Lgr5Q9Z1P4 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Lgr5Q9Z1P4 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Lgr5Q9Z1P4 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Lgr5Q9Z1P4 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
Lgr5Q9Z1P4 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Lgr5Q9Z1P4 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Lgr5Q9Z1P4 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Lgr5Q9Z1P4 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Lgr5Q9Z1P4 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Lgr5Q9Z1P4 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Lgr5Q9Z1P4 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46 ms