Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1K5

Arih1, E3 ubiquitin-protein ligase ARIH1, mousemouse

Predictions only

Length 555 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arih1Q9Z1K5 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
Arih1Q9Z1K5 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Arih1Q9Z1K5 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Arih1Q9Z1K5 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Arih1Q9Z1K5 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Arih1Q9Z1K5 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Arih1Q9Z1K5 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Arih1Q9Z1K5 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Arih1Q9Z1K5 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Arih1Q9Z1K5 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
Arih1Q9Z1K5 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
Arih1Q9Z1K5 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
Arih1Q9Z1K5 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Arih1Q9Z1K5 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Arih1Q9Z1K5 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Arih1Q9Z1K5 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Arih1Q9Z1K5 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Arih1Q9Z1K5 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Arih1Q9Z1K5 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Arih1Q9Z1K5 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.65
Arih1Q9Z1K5 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Arih1Q9Z1K5 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Arih1Q9Z1K5 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Arih1Q9Z1K5 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Arih1Q9Z1K5 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Arih1Q9Z1K5 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Arih1Q9Z1K5 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Arih1Q9Z1K5 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Arih1Q9Z1K5 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Arih1Q9Z1K5 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Arih1Q9Z1K5 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Arih1Q9Z1K5 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Arih1Q9Z1K5 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Arih1Q9Z1K5 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Arih1Q9Z1K5 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Arih1Q9Z1K5 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Arih1Q9Z1K5 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Arih1Q9Z1K5 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Arih1Q9Z1K5 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Arih1Q9Z1K5 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Arih1Q9Z1K5 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Arih1Q9Z1K5 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Arih1Q9Z1K5 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Arih1Q9Z1K5 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Arih1Q9Z1K5 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Arih1Q9Z1K5 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
Arih1Q9Z1K5 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Arih1Q9Z1K5 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Arih1Q9Z1K5 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Arih1Q9Z1K5 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Arih1Q9Z1K5 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
Arih1Q9Z1K5 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Arih1Q9Z1K5 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Arih1Q9Z1K5 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Arih1Q9Z1K5 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Arih1Q9Z1K5 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Arih1Q9Z1K5 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Arih1Q9Z1K5 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Arih1Q9Z1K5 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Arih1Q9Z1K5 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Arih1Q9Z1K5 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Arih1Q9Z1K5 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Arih1Q9Z1K5 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
Arih1Q9Z1K5 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
Arih1Q9Z1K5 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Arih1Q9Z1K5 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Arih1Q9Z1K5 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Arih1Q9Z1K5 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Arih1Q9Z1K5 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Arih1Q9Z1K5 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Arih1Q9Z1K5 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
Arih1Q9Z1K5 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Arih1Q9Z1K5 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Arih1Q9Z1K5 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Arih1Q9Z1K5 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Arih1Q9Z1K5 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
Arih1Q9Z1K5 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Arih1Q9Z1K5 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Arih1Q9Z1K5 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Arih1Q9Z1K5 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Arih1Q9Z1K5 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Arih1Q9Z1K5 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Arih1Q9Z1K5 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Arih1Q9Z1K5 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Arih1Q9Z1K5 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Arih1Q9Z1K5 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Arih1Q9Z1K5 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Arih1Q9Z1K5 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Arih1Q9Z1K5 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Arih1Q9Z1K5 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Arih1Q9Z1K5 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
Arih1Q9Z1K5 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Arih1Q9Z1K5 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Arih1Q9Z1K5 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Arih1Q9Z1K5 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Arih1Q9Z1K5 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Arih1Q9Z1K5 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Arih1Q9Z1K5 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Arih1Q9Z1K5 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Arih1Q9Z1K5 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.5 ms