Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z131

Sh3bp5, SH3 domain-binding protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 463 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp5Q9Z131 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Sh3bp5Q9Z131 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Sh3bp5Q9Z131 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Sh3bp5Q9Z131 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Sh3bp5Q9Z131 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Sh3bp5Q9Z131 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Sh3bp5Q9Z131 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Sh3bp5Q9Z131 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Sh3bp5Q9Z131 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Sh3bp5Q9Z131 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Sh3bp5Q9Z131 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Sh3bp5Q9Z131 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Sh3bp5Q9Z131 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Sh3bp5Q9Z131 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Sh3bp5Q9Z131 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Sh3bp5Q9Z131 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
Sh3bp5Q9Z131 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
Sh3bp5Q9Z131 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
Sh3bp5Q9Z131 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Sh3bp5Q9Z131 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Sh3bp5Q9Z131 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Sh3bp5Q9Z131 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Sh3bp5Q9Z131 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Sh3bp5Q9Z131 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Sh3bp5Q9Z131 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Sh3bp5Q9Z131 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Sh3bp5Q9Z131 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Sh3bp5Q9Z131 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Sh3bp5Q9Z131 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Sh3bp5Q9Z131 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Sh3bp5Q9Z131 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Sh3bp5Q9Z131 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Sh3bp5Q9Z131 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Sh3bp5Q9Z131 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Sh3bp5Q9Z131 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Sh3bp5Q9Z131 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Sh3bp5Q9Z131 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Sh3bp5Q9Z131 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Sh3bp5Q9Z131 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Sh3bp5Q9Z131 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Sh3bp5Q9Z131 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
Sh3bp5Q9Z131 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Sh3bp5Q9Z131 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Sh3bp5Q9Z131 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Sh3bp5Q9Z131 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Sh3bp5Q9Z131 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
Sh3bp5Q9Z131 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
Sh3bp5Q9Z131 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.93
Sh3bp5Q9Z131 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Sh3bp5Q9Z131 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Sh3bp5Q9Z131 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Sh3bp5Q9Z131 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Sh3bp5Q9Z131 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Sh3bp5Q9Z131 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Sh3bp5Q9Z131 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Sh3bp5Q9Z131 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Sh3bp5Q9Z131 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
Sh3bp5Q9Z131 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Sh3bp5Q9Z131 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Sh3bp5Q9Z131 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Sh3bp5Q9Z131 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Sh3bp5Q9Z131 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Sh3bp5Q9Z131 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Sh3bp5Q9Z131 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Sh3bp5Q9Z131 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Sh3bp5Q9Z131 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Sh3bp5Q9Z131 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Sh3bp5Q9Z131 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Sh3bp5Q9Z131 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Sh3bp5Q9Z131 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Sh3bp5Q9Z131 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Sh3bp5Q9Z131 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Sh3bp5Q9Z131 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Sh3bp5Q9Z131 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Sh3bp5Q9Z131 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Sh3bp5Q9Z131 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Sh3bp5Q9Z131 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Sh3bp5Q9Z131 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Sh3bp5Q9Z131 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Sh3bp5Q9Z131 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
Sh3bp5Q9Z131 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Sh3bp5Q9Z131 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Sh3bp5Q9Z131 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Sh3bp5Q9Z131 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Sh3bp5Q9Z131 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Sh3bp5Q9Z131 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Sh3bp5Q9Z131 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Sh3bp5Q9Z131 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Sh3bp5Q9Z131 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
Sh3bp5Q9Z131 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Sh3bp5Q9Z131 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Sh3bp5Q9Z131 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Sh3bp5Q9Z131 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Sh3bp5Q9Z131 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Sh3bp5Q9Z131 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
Sh3bp5Q9Z131 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Sh3bp5Q9Z131 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Sh3bp5Q9Z131 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Sh3bp5Q9Z131 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Sh3bp5Q9Z131 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.4 ms