Protein–RNA interactions for Protein: Q9R233

Tapbp, Tapasin, mousemouse

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TapbpQ9R233 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
TapbpQ9R233 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TapbpQ9R233 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TapbpQ9R233 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TapbpQ9R233 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TapbpQ9R233 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TapbpQ9R233 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TapbpQ9R233 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TapbpQ9R233 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TapbpQ9R233 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TapbpQ9R233 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TapbpQ9R233 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TapbpQ9R233 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TapbpQ9R233 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
TapbpQ9R233 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TapbpQ9R233 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TapbpQ9R233 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TapbpQ9R233 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TapbpQ9R233 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TapbpQ9R233 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TapbpQ9R233 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TapbpQ9R233 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
TapbpQ9R233 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
TapbpQ9R233 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TapbpQ9R233 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TapbpQ9R233 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TapbpQ9R233 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TapbpQ9R233 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TapbpQ9R233 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
TapbpQ9R233 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TapbpQ9R233 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TapbpQ9R233 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TapbpQ9R233 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TapbpQ9R233 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TapbpQ9R233 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TapbpQ9R233 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TapbpQ9R233 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
TapbpQ9R233 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TapbpQ9R233 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TapbpQ9R233 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TapbpQ9R233 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TapbpQ9R233 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TapbpQ9R233 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TapbpQ9R233 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
TapbpQ9R233 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
TapbpQ9R233 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
TapbpQ9R233 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
TapbpQ9R233 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TapbpQ9R233 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TapbpQ9R233 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TapbpQ9R233 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TapbpQ9R233 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TapbpQ9R233 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
TapbpQ9R233 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TapbpQ9R233 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TapbpQ9R233 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TapbpQ9R233 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TapbpQ9R233 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TapbpQ9R233 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TapbpQ9R233 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TapbpQ9R233 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
TapbpQ9R233 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TapbpQ9R233 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TapbpQ9R233 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
TapbpQ9R233 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TapbpQ9R233 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TapbpQ9R233 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TapbpQ9R233 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TapbpQ9R233 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TapbpQ9R233 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TapbpQ9R233 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TapbpQ9R233 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TapbpQ9R233 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
TapbpQ9R233 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TapbpQ9R233 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TapbpQ9R233 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
TapbpQ9R233 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
TapbpQ9R233 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
TapbpQ9R233 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
TapbpQ9R233 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
TapbpQ9R233 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC20.02■□□□□ 0.79
TapbpQ9R233 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
TapbpQ9R233 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TapbpQ9R233 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TapbpQ9R233 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
TapbpQ9R233 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
TapbpQ9R233 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TapbpQ9R233 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TapbpQ9R233 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC20■□□□□ 0.79
TapbpQ9R233 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TapbpQ9R233 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
TapbpQ9R233 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
TapbpQ9R233 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TapbpQ9R233 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TapbpQ9R233 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TapbpQ9R233 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TapbpQ9R233 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
TapbpQ9R233 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
TapbpQ9R233 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
TapbpQ9R233 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 76.9 ms