Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZD4

Ercc4, DNA repair endonuclease XPF, mousemouse

Predictions only

Length 917 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ercc4Q9QZD4 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ercc4Q9QZD4 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Ercc4Q9QZD4 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Ercc4Q9QZD4 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Ercc4Q9QZD4 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Ercc4Q9QZD4 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Ercc4Q9QZD4 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ercc4Q9QZD4 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ercc4Q9QZD4 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ercc4Q9QZD4 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ercc4Q9QZD4 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ercc4Q9QZD4 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Ercc4Q9QZD4 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ercc4Q9QZD4 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ercc4Q9QZD4 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ercc4Q9QZD4 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ercc4Q9QZD4 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ercc4Q9QZD4 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ercc4Q9QZD4 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ercc4Q9QZD4 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ercc4Q9QZD4 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ercc4Q9QZD4 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
Ercc4Q9QZD4 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ercc4Q9QZD4 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ercc4Q9QZD4 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ercc4Q9QZD4 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ercc4Q9QZD4 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ercc4Q9QZD4 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
Ercc4Q9QZD4 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ercc4Q9QZD4 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ercc4Q9QZD4 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ercc4Q9QZD4 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ercc4Q9QZD4 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
Ercc4Q9QZD4 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ercc4Q9QZD4 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ercc4Q9QZD4 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ercc4Q9QZD4 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ercc4Q9QZD4 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ercc4Q9QZD4 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ercc4Q9QZD4 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ercc4Q9QZD4 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ercc4Q9QZD4 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ercc4Q9QZD4 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ercc4Q9QZD4 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ercc4Q9QZD4 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ercc4Q9QZD4 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ercc4Q9QZD4 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ercc4Q9QZD4 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ercc4Q9QZD4 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
Ercc4Q9QZD4 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ercc4Q9QZD4 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
Ercc4Q9QZD4 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ercc4Q9QZD4 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Ercc4Q9QZD4 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
Ercc4Q9QZD4 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Ercc4Q9QZD4 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Ercc4Q9QZD4 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ercc4Q9QZD4 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ercc4Q9QZD4 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ercc4Q9QZD4 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
Ercc4Q9QZD4 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ercc4Q9QZD4 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ercc4Q9QZD4 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ercc4Q9QZD4 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ercc4Q9QZD4 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ercc4Q9QZD4 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ercc4Q9QZD4 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
Ercc4Q9QZD4 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ercc4Q9QZD4 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ercc4Q9QZD4 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ercc4Q9QZD4 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
Ercc4Q9QZD4 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ercc4Q9QZD4 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
Ercc4Q9QZD4 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ercc4Q9QZD4 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ercc4Q9QZD4 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ercc4Q9QZD4 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ercc4Q9QZD4 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ercc4Q9QZD4 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
Ercc4Q9QZD4 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ercc4Q9QZD4 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ercc4Q9QZD4 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ercc4Q9QZD4 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ercc4Q9QZD4 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Ercc4Q9QZD4 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Ercc4Q9QZD4 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Ercc4Q9QZD4 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Ercc4Q9QZD4 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Ercc4Q9QZD4 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ercc4Q9QZD4 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ercc4Q9QZD4 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ercc4Q9QZD4 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ercc4Q9QZD4 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ercc4Q9QZD4 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ercc4Q9QZD4 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ercc4Q9QZD4 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ercc4Q9QZD4 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ercc4Q9QZD4 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ercc4Q9QZD4 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ercc4Q9QZD4 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.8 ms