Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZ11

Exo1, Exonuclease 1, mousemouse

Predictions only

Length 837 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Exo1Q9QZ11 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Exo1Q9QZ11 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Exo1Q9QZ11 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Exo1Q9QZ11 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Exo1Q9QZ11 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Exo1Q9QZ11 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Exo1Q9QZ11 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Exo1Q9QZ11 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Exo1Q9QZ11 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Exo1Q9QZ11 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Exo1Q9QZ11 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Exo1Q9QZ11 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Exo1Q9QZ11 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Exo1Q9QZ11 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Exo1Q9QZ11 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Exo1Q9QZ11 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Exo1Q9QZ11 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Exo1Q9QZ11 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Exo1Q9QZ11 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Exo1Q9QZ11 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Exo1Q9QZ11 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Exo1Q9QZ11 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Exo1Q9QZ11 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Exo1Q9QZ11 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Exo1Q9QZ11 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Exo1Q9QZ11 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Exo1Q9QZ11 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Exo1Q9QZ11 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Exo1Q9QZ11 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Exo1Q9QZ11 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Exo1Q9QZ11 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Exo1Q9QZ11 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Exo1Q9QZ11 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Exo1Q9QZ11 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Exo1Q9QZ11 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Exo1Q9QZ11 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Exo1Q9QZ11 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Exo1Q9QZ11 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Exo1Q9QZ11 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Exo1Q9QZ11 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Exo1Q9QZ11 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Exo1Q9QZ11 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Exo1Q9QZ11 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC20.33■□□□□ 0.84
Exo1Q9QZ11 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Exo1Q9QZ11 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Exo1Q9QZ11 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Exo1Q9QZ11 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Exo1Q9QZ11 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Exo1Q9QZ11 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Exo1Q9QZ11 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Exo1Q9QZ11 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Exo1Q9QZ11 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Exo1Q9QZ11 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Exo1Q9QZ11 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Exo1Q9QZ11 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Exo1Q9QZ11 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Exo1Q9QZ11 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Exo1Q9QZ11 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Exo1Q9QZ11 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Exo1Q9QZ11 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Exo1Q9QZ11 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Exo1Q9QZ11 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Exo1Q9QZ11 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Exo1Q9QZ11 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Exo1Q9QZ11 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Exo1Q9QZ11 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Exo1Q9QZ11 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Exo1Q9QZ11 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Exo1Q9QZ11 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Exo1Q9QZ11 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Exo1Q9QZ11 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Exo1Q9QZ11 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Exo1Q9QZ11 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Exo1Q9QZ11 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Exo1Q9QZ11 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Exo1Q9QZ11 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Exo1Q9QZ11 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Exo1Q9QZ11 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Exo1Q9QZ11 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Exo1Q9QZ11 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Exo1Q9QZ11 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Exo1Q9QZ11 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Exo1Q9QZ11 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Exo1Q9QZ11 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Exo1Q9QZ11 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Exo1Q9QZ11 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Exo1Q9QZ11 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Exo1Q9QZ11 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Exo1Q9QZ11 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Exo1Q9QZ11 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Exo1Q9QZ11 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Exo1Q9QZ11 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Exo1Q9QZ11 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Exo1Q9QZ11 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Exo1Q9QZ11 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Exo1Q9QZ11 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Exo1Q9QZ11 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Exo1Q9QZ11 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Exo1Q9QZ11 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Exo1Q9QZ11 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
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