Protein–RNA interactions for Protein: Q9QYE3

Bcl11a, B-cell lymphoma/leukemia 11A, mousemouse

Predictions only

Length 773 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bcl11aQ9QYE3 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Bcl11aQ9QYE3 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Bcl11aQ9QYE3 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Bcl11aQ9QYE3 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Bcl11aQ9QYE3 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
Bcl11aQ9QYE3 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Bcl11aQ9QYE3 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Bcl11aQ9QYE3 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Bcl11aQ9QYE3 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Bcl11aQ9QYE3 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Bcl11aQ9QYE3 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Bcl11aQ9QYE3 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Bcl11aQ9QYE3 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Bcl11aQ9QYE3 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Bcl11aQ9QYE3 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
Bcl11aQ9QYE3 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
Bcl11aQ9QYE3 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
Bcl11aQ9QYE3 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Bcl11aQ9QYE3 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Bcl11aQ9QYE3 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Bcl11aQ9QYE3 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Bcl11aQ9QYE3 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Bcl11aQ9QYE3 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Bcl11aQ9QYE3 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Bcl11aQ9QYE3 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Bcl11aQ9QYE3 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Bcl11aQ9QYE3 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Bcl11aQ9QYE3 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Bcl11aQ9QYE3 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Bcl11aQ9QYE3 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Bcl11aQ9QYE3 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Bcl11aQ9QYE3 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Bcl11aQ9QYE3 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Bcl11aQ9QYE3 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Bcl11aQ9QYE3 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Bcl11aQ9QYE3 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Bcl11aQ9QYE3 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Bcl11aQ9QYE3 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Bcl11aQ9QYE3 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Bcl11aQ9QYE3 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
Bcl11aQ9QYE3 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Bcl11aQ9QYE3 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Bcl11aQ9QYE3 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Bcl11aQ9QYE3 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Bcl11aQ9QYE3 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Bcl11aQ9QYE3 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Bcl11aQ9QYE3 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Bcl11aQ9QYE3 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Bcl11aQ9QYE3 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Bcl11aQ9QYE3 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
Bcl11aQ9QYE3 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
Bcl11aQ9QYE3 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.93
Bcl11aQ9QYE3 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Bcl11aQ9QYE3 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Bcl11aQ9QYE3 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Bcl11aQ9QYE3 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Bcl11aQ9QYE3 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Bcl11aQ9QYE3 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Bcl11aQ9QYE3 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Bcl11aQ9QYE3 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Bcl11aQ9QYE3 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Bcl11aQ9QYE3 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Bcl11aQ9QYE3 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Bcl11aQ9QYE3 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Bcl11aQ9QYE3 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Bcl11aQ9QYE3 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Bcl11aQ9QYE3 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Bcl11aQ9QYE3 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Bcl11aQ9QYE3 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Bcl11aQ9QYE3 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Bcl11aQ9QYE3 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Bcl11aQ9QYE3 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Bcl11aQ9QYE3 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Bcl11aQ9QYE3 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Bcl11aQ9QYE3 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Bcl11aQ9QYE3 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Bcl11aQ9QYE3 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Bcl11aQ9QYE3 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Bcl11aQ9QYE3 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Bcl11aQ9QYE3 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Bcl11aQ9QYE3 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Bcl11aQ9QYE3 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Bcl11aQ9QYE3 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
Bcl11aQ9QYE3 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Bcl11aQ9QYE3 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Bcl11aQ9QYE3 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Bcl11aQ9QYE3 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Bcl11aQ9QYE3 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Bcl11aQ9QYE3 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Bcl11aQ9QYE3 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Bcl11aQ9QYE3 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Bcl11aQ9QYE3 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Bcl11aQ9QYE3 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Bcl11aQ9QYE3 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Bcl11aQ9QYE3 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Bcl11aQ9QYE3 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Bcl11aQ9QYE3 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Bcl11aQ9QYE3 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Bcl11aQ9QYE3 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Bcl11aQ9QYE3 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 751.1 ms