Protein–RNA interactions for Protein: Q9QY76

Vapb, Vesicle-associated membrane protein-associated protein B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 243 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VapbQ9QY76 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
VapbQ9QY76 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
VapbQ9QY76 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
VapbQ9QY76 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
VapbQ9QY76 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
VapbQ9QY76 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
VapbQ9QY76 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
VapbQ9QY76 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
VapbQ9QY76 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
VapbQ9QY76 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
VapbQ9QY76 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.02
VapbQ9QY76 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
VapbQ9QY76 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
VapbQ9QY76 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
VapbQ9QY76 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
VapbQ9QY76 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
VapbQ9QY76 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
VapbQ9QY76 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
VapbQ9QY76 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
VapbQ9QY76 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
VapbQ9QY76 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
VapbQ9QY76 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
VapbQ9QY76 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
VapbQ9QY76 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
VapbQ9QY76 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
VapbQ9QY76 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
VapbQ9QY76 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
VapbQ9QY76 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
VapbQ9QY76 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
VapbQ9QY76 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
VapbQ9QY76 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
VapbQ9QY76 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
VapbQ9QY76 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
VapbQ9QY76 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
VapbQ9QY76 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
VapbQ9QY76 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
VapbQ9QY76 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
VapbQ9QY76 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
VapbQ9QY76 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
VapbQ9QY76 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
VapbQ9QY76 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
VapbQ9QY76 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
VapbQ9QY76 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
VapbQ9QY76 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
VapbQ9QY76 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
VapbQ9QY76 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
VapbQ9QY76 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
VapbQ9QY76 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
VapbQ9QY76 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
VapbQ9QY76 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
VapbQ9QY76 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
VapbQ9QY76 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC21.31■■□□□ 1
VapbQ9QY76 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
VapbQ9QY76 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
VapbQ9QY76 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
VapbQ9QY76 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
VapbQ9QY76 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
VapbQ9QY76 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
VapbQ9QY76 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC21.31■■□□□ 1
VapbQ9QY76 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
VapbQ9QY76 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
VapbQ9QY76 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
VapbQ9QY76 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
VapbQ9QY76 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
VapbQ9QY76 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
VapbQ9QY76 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC21.29■■□□□ 1
VapbQ9QY76 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
VapbQ9QY76 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
VapbQ9QY76 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
VapbQ9QY76 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
VapbQ9QY76 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
VapbQ9QY76 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
VapbQ9QY76 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
VapbQ9QY76 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
VapbQ9QY76 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
VapbQ9QY76 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
VapbQ9QY76 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
VapbQ9QY76 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
VapbQ9QY76 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
VapbQ9QY76 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
VapbQ9QY76 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
VapbQ9QY76 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
VapbQ9QY76 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC21.27■□□□□ 0.99
VapbQ9QY76 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
VapbQ9QY76 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
VapbQ9QY76 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
VapbQ9QY76 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
VapbQ9QY76 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
VapbQ9QY76 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
VapbQ9QY76 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
VapbQ9QY76 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
VapbQ9QY76 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
VapbQ9QY76 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
VapbQ9QY76 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
VapbQ9QY76 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
VapbQ9QY76 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
VapbQ9QY76 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
VapbQ9QY76 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
VapbQ9QY76 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
VapbQ9QY76 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 79.9 ms