Protein–RNA interactions for Protein: Q9QY30

Abcb11, Bile salt export pump, mousemouse

Predictions only

Length 1,321 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcb11Q9QY30 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Abcb11Q9QY30 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Abcb11Q9QY30 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Abcb11Q9QY30 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Abcb11Q9QY30 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Abcb11Q9QY30 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Abcb11Q9QY30 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Abcb11Q9QY30 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Abcb11Q9QY30 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Abcb11Q9QY30 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Abcb11Q9QY30 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Abcb11Q9QY30 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Abcb11Q9QY30 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Abcb11Q9QY30 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Abcb11Q9QY30 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Abcb11Q9QY30 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Abcb11Q9QY30 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Abcb11Q9QY30 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Abcb11Q9QY30 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Abcb11Q9QY30 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Abcb11Q9QY30 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Abcb11Q9QY30 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Abcb11Q9QY30 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Abcb11Q9QY30 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Abcb11Q9QY30 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Abcb11Q9QY30 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Abcb11Q9QY30 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Abcb11Q9QY30 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Abcb11Q9QY30 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Abcb11Q9QY30 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Abcb11Q9QY30 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Abcb11Q9QY30 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Abcb11Q9QY30 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Abcb11Q9QY30 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Abcb11Q9QY30 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Abcb11Q9QY30 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Abcb11Q9QY30 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Abcb11Q9QY30 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Abcb11Q9QY30 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Abcb11Q9QY30 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Abcb11Q9QY30 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Abcb11Q9QY30 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Abcb11Q9QY30 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Abcb11Q9QY30 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Abcb11Q9QY30 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Abcb11Q9QY30 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Abcb11Q9QY30 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Abcb11Q9QY30 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Abcb11Q9QY30 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Abcb11Q9QY30 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Abcb11Q9QY30 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Abcb11Q9QY30 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Abcb11Q9QY30 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Abcb11Q9QY30 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Abcb11Q9QY30 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Abcb11Q9QY30 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Abcb11Q9QY30 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Abcb11Q9QY30 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Abcb11Q9QY30 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Abcb11Q9QY30 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Abcb11Q9QY30 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Abcb11Q9QY30 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Abcb11Q9QY30 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Abcb11Q9QY30 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Abcb11Q9QY30 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Abcb11Q9QY30 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Abcb11Q9QY30 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Abcb11Q9QY30 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Abcb11Q9QY30 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Abcb11Q9QY30 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Abcb11Q9QY30 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Abcb11Q9QY30 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC24.33■■□□□ 1.48
Abcb11Q9QY30 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
Abcb11Q9QY30 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.48
Abcb11Q9QY30 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.48
Abcb11Q9QY30 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.48
Abcb11Q9QY30 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Abcb11Q9QY30 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Abcb11Q9QY30 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Abcb11Q9QY30 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Abcb11Q9QY30 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Abcb11Q9QY30 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Abcb11Q9QY30 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Abcb11Q9QY30 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Abcb11Q9QY30 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Abcb11Q9QY30 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Abcb11Q9QY30 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Abcb11Q9QY30 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Abcb11Q9QY30 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Abcb11Q9QY30 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Abcb11Q9QY30 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Abcb11Q9QY30 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Abcb11Q9QY30 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Abcb11Q9QY30 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Abcb11Q9QY30 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Abcb11Q9QY30 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Abcb11Q9QY30 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Abcb11Q9QY30 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Abcb11Q9QY30 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Abcb11Q9QY30 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.8 ms