Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXW4

Fscn3, Fascin-3, mousemouse

Predictions only

Length 498 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fscn3Q9QXW4 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Fscn3Q9QXW4 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Fscn3Q9QXW4 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Fscn3Q9QXW4 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Fscn3Q9QXW4 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Fscn3Q9QXW4 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Fscn3Q9QXW4 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Fscn3Q9QXW4 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Fscn3Q9QXW4 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Fscn3Q9QXW4 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Fscn3Q9QXW4 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Fscn3Q9QXW4 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Fscn3Q9QXW4 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
Fscn3Q9QXW4 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Fscn3Q9QXW4 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
Fscn3Q9QXW4 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Fscn3Q9QXW4 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Fscn3Q9QXW4 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
Fscn3Q9QXW4 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Fscn3Q9QXW4 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Fscn3Q9QXW4 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Fscn3Q9QXW4 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Fscn3Q9QXW4 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
Fscn3Q9QXW4 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Fscn3Q9QXW4 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Fscn3Q9QXW4 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Fscn3Q9QXW4 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Fscn3Q9QXW4 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Fscn3Q9QXW4 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Fscn3Q9QXW4 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Fscn3Q9QXW4 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Fscn3Q9QXW4 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Fscn3Q9QXW4 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Fscn3Q9QXW4 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Fscn3Q9QXW4 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Fscn3Q9QXW4 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Fscn3Q9QXW4 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Fscn3Q9QXW4 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Fscn3Q9QXW4 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
Fscn3Q9QXW4 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Fscn3Q9QXW4 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Fscn3Q9QXW4 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Fscn3Q9QXW4 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Fscn3Q9QXW4 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Fscn3Q9QXW4 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Fscn3Q9QXW4 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Fscn3Q9QXW4 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Fscn3Q9QXW4 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Fscn3Q9QXW4 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Fscn3Q9QXW4 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Fscn3Q9QXW4 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Fscn3Q9QXW4 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Fscn3Q9QXW4 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Fscn3Q9QXW4 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Fscn3Q9QXW4 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Fscn3Q9QXW4 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Fscn3Q9QXW4 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Fscn3Q9QXW4 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Fscn3Q9QXW4 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Fscn3Q9QXW4 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Fscn3Q9QXW4 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Fscn3Q9QXW4 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Fscn3Q9QXW4 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Fscn3Q9QXW4 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Fscn3Q9QXW4 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Fscn3Q9QXW4 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Fscn3Q9QXW4 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Fscn3Q9QXW4 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Fscn3Q9QXW4 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Fscn3Q9QXW4 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Fscn3Q9QXW4 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Fscn3Q9QXW4 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Fscn3Q9QXW4 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Fscn3Q9QXW4 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Fscn3Q9QXW4 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Fscn3Q9QXW4 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Fscn3Q9QXW4 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Fscn3Q9QXW4 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Fscn3Q9QXW4 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Fscn3Q9QXW4 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Fscn3Q9QXW4 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Fscn3Q9QXW4 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Fscn3Q9QXW4 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Fscn3Q9QXW4 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Fscn3Q9QXW4 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Fscn3Q9QXW4 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Fscn3Q9QXW4 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Fscn3Q9QXW4 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Fscn3Q9QXW4 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Fscn3Q9QXW4 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
Fscn3Q9QXW4 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Fscn3Q9QXW4 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Fscn3Q9QXW4 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Fscn3Q9QXW4 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Fscn3Q9QXW4 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Fscn3Q9QXW4 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Fscn3Q9QXW4 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Fscn3Q9QXW4 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Fscn3Q9QXW4 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Fscn3Q9QXW4 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.7 ms