Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXK3

Copg2, Coatomer subunit gamma-2, mousemouse

Predictions only

Length 871 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Copg2Q9QXK3 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Copg2Q9QXK3 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Copg2Q9QXK3 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Copg2Q9QXK3 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Copg2Q9QXK3 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Copg2Q9QXK3 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Copg2Q9QXK3 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Copg2Q9QXK3 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Copg2Q9QXK3 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Copg2Q9QXK3 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Copg2Q9QXK3 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Copg2Q9QXK3 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Copg2Q9QXK3 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Copg2Q9QXK3 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Copg2Q9QXK3 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Copg2Q9QXK3 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Copg2Q9QXK3 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Copg2Q9QXK3 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Copg2Q9QXK3 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Copg2Q9QXK3 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Copg2Q9QXK3 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Copg2Q9QXK3 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Copg2Q9QXK3 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Copg2Q9QXK3 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Copg2Q9QXK3 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Copg2Q9QXK3 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Copg2Q9QXK3 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Copg2Q9QXK3 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Copg2Q9QXK3 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Copg2Q9QXK3 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Copg2Q9QXK3 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Copg2Q9QXK3 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Copg2Q9QXK3 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Copg2Q9QXK3 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Copg2Q9QXK3 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Copg2Q9QXK3 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Copg2Q9QXK3 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Copg2Q9QXK3 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Copg2Q9QXK3 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Copg2Q9QXK3 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Copg2Q9QXK3 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Copg2Q9QXK3 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Copg2Q9QXK3 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Copg2Q9QXK3 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Copg2Q9QXK3 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Copg2Q9QXK3 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Copg2Q9QXK3 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Copg2Q9QXK3 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Copg2Q9QXK3 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Copg2Q9QXK3 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Copg2Q9QXK3 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Copg2Q9QXK3 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Copg2Q9QXK3 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Copg2Q9QXK3 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Copg2Q9QXK3 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Copg2Q9QXK3 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Copg2Q9QXK3 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Copg2Q9QXK3 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Copg2Q9QXK3 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Copg2Q9QXK3 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Copg2Q9QXK3 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Copg2Q9QXK3 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Copg2Q9QXK3 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Copg2Q9QXK3 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Copg2Q9QXK3 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Copg2Q9QXK3 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Copg2Q9QXK3 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Copg2Q9QXK3 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Copg2Q9QXK3 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Copg2Q9QXK3 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Copg2Q9QXK3 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Copg2Q9QXK3 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Copg2Q9QXK3 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Copg2Q9QXK3 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Copg2Q9QXK3 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Copg2Q9QXK3 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Copg2Q9QXK3 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Copg2Q9QXK3 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Copg2Q9QXK3 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Copg2Q9QXK3 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Copg2Q9QXK3 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Copg2Q9QXK3 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Copg2Q9QXK3 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Copg2Q9QXK3 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Copg2Q9QXK3 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Copg2Q9QXK3 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Copg2Q9QXK3 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Copg2Q9QXK3 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Copg2Q9QXK3 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Copg2Q9QXK3 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Copg2Q9QXK3 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Copg2Q9QXK3 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Copg2Q9QXK3 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Copg2Q9QXK3 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Copg2Q9QXK3 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Copg2Q9QXK3 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Copg2Q9QXK3 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Copg2Q9QXK3 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Copg2Q9QXK3 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Copg2Q9QXK3 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.4 ms