Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXE4

Trp53inp1, Tumor protein p53-inducible nuclear protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trp53inp1Q9QXE4 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Trp53inp1Q9QXE4 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Trp53inp1Q9QXE4 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Trp53inp1Q9QXE4 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Trp53inp1Q9QXE4 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Trp53inp1Q9QXE4 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Trp53inp1Q9QXE4 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Trp53inp1Q9QXE4 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Trp53inp1Q9QXE4 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Trp53inp1Q9QXE4 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Trp53inp1Q9QXE4 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Trp53inp1Q9QXE4 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Trp53inp1Q9QXE4 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Trp53inp1Q9QXE4 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Trp53inp1Q9QXE4 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Trp53inp1Q9QXE4 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Trp53inp1Q9QXE4 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Trp53inp1Q9QXE4 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Trp53inp1Q9QXE4 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Trp53inp1Q9QXE4 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Trp53inp1Q9QXE4 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Trp53inp1Q9QXE4 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Trp53inp1Q9QXE4 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Trp53inp1Q9QXE4 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Trp53inp1Q9QXE4 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Trp53inp1Q9QXE4 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Trp53inp1Q9QXE4 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Trp53inp1Q9QXE4 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Trp53inp1Q9QXE4 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Trp53inp1Q9QXE4 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Trp53inp1Q9QXE4 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Trp53inp1Q9QXE4 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Trp53inp1Q9QXE4 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
Trp53inp1Q9QXE4 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Trp53inp1Q9QXE4 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Trp53inp1Q9QXE4 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Trp53inp1Q9QXE4 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Trp53inp1Q9QXE4 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Trp53inp1Q9QXE4 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Trp53inp1Q9QXE4 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
Trp53inp1Q9QXE4 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Trp53inp1Q9QXE4 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
Trp53inp1Q9QXE4 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Trp53inp1Q9QXE4 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Trp53inp1Q9QXE4 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Trp53inp1Q9QXE4 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
Trp53inp1Q9QXE4 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Trp53inp1Q9QXE4 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
Trp53inp1Q9QXE4 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Trp53inp1Q9QXE4 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Trp53inp1Q9QXE4 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Trp53inp1Q9QXE4 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Trp53inp1Q9QXE4 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Trp53inp1Q9QXE4 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Trp53inp1Q9QXE4 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Trp53inp1Q9QXE4 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Trp53inp1Q9QXE4 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Trp53inp1Q9QXE4 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Trp53inp1Q9QXE4 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Trp53inp1Q9QXE4 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Trp53inp1Q9QXE4 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Trp53inp1Q9QXE4 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Trp53inp1Q9QXE4 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Trp53inp1Q9QXE4 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
Trp53inp1Q9QXE4 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Trp53inp1Q9QXE4 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Trp53inp1Q9QXE4 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Trp53inp1Q9QXE4 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Trp53inp1Q9QXE4 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Trp53inp1Q9QXE4 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Trp53inp1Q9QXE4 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Trp53inp1Q9QXE4 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Trp53inp1Q9QXE4 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
Trp53inp1Q9QXE4 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Trp53inp1Q9QXE4 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Trp53inp1Q9QXE4 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Trp53inp1Q9QXE4 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Trp53inp1Q9QXE4 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Trp53inp1Q9QXE4 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Trp53inp1Q9QXE4 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Trp53inp1Q9QXE4 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Trp53inp1Q9QXE4 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Trp53inp1Q9QXE4 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Trp53inp1Q9QXE4 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Trp53inp1Q9QXE4 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Trp53inp1Q9QXE4 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Trp53inp1Q9QXE4 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Trp53inp1Q9QXE4 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Trp53inp1Q9QXE4 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Trp53inp1Q9QXE4 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
Trp53inp1Q9QXE4 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
Trp53inp1Q9QXE4 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Trp53inp1Q9QXE4 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Trp53inp1Q9QXE4 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
Trp53inp1Q9QXE4 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Trp53inp1Q9QXE4 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Trp53inp1Q9QXE4 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Trp53inp1Q9QXE4 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Trp53inp1Q9QXE4 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Trp53inp1Q9QXE4 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.7 ms