Protein–RNA interactions for Protein: Q9QWF0

Chaf1a, Chromatin assembly factor 1 subunit A, mousemouse

Predictions only

Length 911 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chaf1aQ9QWF0 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Chaf1aQ9QWF0 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Chaf1aQ9QWF0 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Chaf1aQ9QWF0 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Chaf1aQ9QWF0 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Chaf1aQ9QWF0 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Chaf1aQ9QWF0 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
Chaf1aQ9QWF0 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Chaf1aQ9QWF0 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Chaf1aQ9QWF0 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Chaf1aQ9QWF0 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Chaf1aQ9QWF0 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Chaf1aQ9QWF0 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Chaf1aQ9QWF0 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Chaf1aQ9QWF0 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
Chaf1aQ9QWF0 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Chaf1aQ9QWF0 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Chaf1aQ9QWF0 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Chaf1aQ9QWF0 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Chaf1aQ9QWF0 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Chaf1aQ9QWF0 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Chaf1aQ9QWF0 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Chaf1aQ9QWF0 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Chaf1aQ9QWF0 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Chaf1aQ9QWF0 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Chaf1aQ9QWF0 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Chaf1aQ9QWF0 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Chaf1aQ9QWF0 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Chaf1aQ9QWF0 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Chaf1aQ9QWF0 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Chaf1aQ9QWF0 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Chaf1aQ9QWF0 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Chaf1aQ9QWF0 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Chaf1aQ9QWF0 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Chaf1aQ9QWF0 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Chaf1aQ9QWF0 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Chaf1aQ9QWF0 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Chaf1aQ9QWF0 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Chaf1aQ9QWF0 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Chaf1aQ9QWF0 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Chaf1aQ9QWF0 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Chaf1aQ9QWF0 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Chaf1aQ9QWF0 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Chaf1aQ9QWF0 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Chaf1aQ9QWF0 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Chaf1aQ9QWF0 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Chaf1aQ9QWF0 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Chaf1aQ9QWF0 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Chaf1aQ9QWF0 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Chaf1aQ9QWF0 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
Chaf1aQ9QWF0 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
Chaf1aQ9QWF0 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Chaf1aQ9QWF0 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Chaf1aQ9QWF0 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Chaf1aQ9QWF0 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Chaf1aQ9QWF0 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Chaf1aQ9QWF0 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Chaf1aQ9QWF0 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Chaf1aQ9QWF0 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Chaf1aQ9QWF0 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Chaf1aQ9QWF0 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Chaf1aQ9QWF0 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Chaf1aQ9QWF0 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Chaf1aQ9QWF0 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Chaf1aQ9QWF0 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Chaf1aQ9QWF0 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Chaf1aQ9QWF0 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Chaf1aQ9QWF0 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Chaf1aQ9QWF0 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Chaf1aQ9QWF0 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Chaf1aQ9QWF0 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Chaf1aQ9QWF0 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Chaf1aQ9QWF0 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Chaf1aQ9QWF0 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
Chaf1aQ9QWF0 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
Chaf1aQ9QWF0 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Chaf1aQ9QWF0 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Chaf1aQ9QWF0 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Chaf1aQ9QWF0 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
Chaf1aQ9QWF0 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Chaf1aQ9QWF0 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Chaf1aQ9QWF0 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Chaf1aQ9QWF0 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Chaf1aQ9QWF0 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Chaf1aQ9QWF0 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Chaf1aQ9QWF0 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Chaf1aQ9QWF0 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Chaf1aQ9QWF0 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Chaf1aQ9QWF0 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Chaf1aQ9QWF0 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Chaf1aQ9QWF0 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Chaf1aQ9QWF0 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Chaf1aQ9QWF0 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Chaf1aQ9QWF0 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Chaf1aQ9QWF0 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Chaf1aQ9QWF0 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Chaf1aQ9QWF0 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Chaf1aQ9QWF0 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Chaf1aQ9QWF0 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Chaf1aQ9QWF0 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.6 ms