Protein–RNA interactions for Protein: Q9JL95

Prg3, Proteoglycan 3, mousemouse

Predictions only

Length 222 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prg3Q9JL95 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Prg3Q9JL95 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Prg3Q9JL95 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Prg3Q9JL95 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Prg3Q9JL95 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Prg3Q9JL95 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Prg3Q9JL95 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Prg3Q9JL95 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Prg3Q9JL95 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Prg3Q9JL95 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Prg3Q9JL95 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Prg3Q9JL95 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Prg3Q9JL95 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Prg3Q9JL95 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Prg3Q9JL95 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Prg3Q9JL95 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Prg3Q9JL95 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Prg3Q9JL95 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
Prg3Q9JL95 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Prg3Q9JL95 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Prg3Q9JL95 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Prg3Q9JL95 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Prg3Q9JL95 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Prg3Q9JL95 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Prg3Q9JL95 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Prg3Q9JL95 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Prg3Q9JL95 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
Prg3Q9JL95 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Prg3Q9JL95 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Prg3Q9JL95 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Prg3Q9JL95 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Prg3Q9JL95 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Prg3Q9JL95 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Prg3Q9JL95 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Prg3Q9JL95 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Prg3Q9JL95 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Prg3Q9JL95 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Prg3Q9JL95 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Prg3Q9JL95 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Prg3Q9JL95 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Prg3Q9JL95 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Prg3Q9JL95 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Prg3Q9JL95 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Prg3Q9JL95 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Prg3Q9JL95 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Prg3Q9JL95 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Prg3Q9JL95 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
Prg3Q9JL95 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
Prg3Q9JL95 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Prg3Q9JL95 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Prg3Q9JL95 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Prg3Q9JL95 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Prg3Q9JL95 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Prg3Q9JL95 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Prg3Q9JL95 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Prg3Q9JL95 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Prg3Q9JL95 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Prg3Q9JL95 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Prg3Q9JL95 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Prg3Q9JL95 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Prg3Q9JL95 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Prg3Q9JL95 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Prg3Q9JL95 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Prg3Q9JL95 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Prg3Q9JL95 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.71
Prg3Q9JL95 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Prg3Q9JL95 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Prg3Q9JL95 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Prg3Q9JL95 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
Prg3Q9JL95 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Prg3Q9JL95 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Prg3Q9JL95 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Prg3Q9JL95 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Prg3Q9JL95 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Prg3Q9JL95 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Prg3Q9JL95 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Prg3Q9JL95 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Prg3Q9JL95 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Prg3Q9JL95 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
Prg3Q9JL95 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Prg3Q9JL95 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Prg3Q9JL95 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Prg3Q9JL95 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Prg3Q9JL95 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Prg3Q9JL95 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Prg3Q9JL95 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Prg3Q9JL95 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
Prg3Q9JL95 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Prg3Q9JL95 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
Prg3Q9JL95 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Prg3Q9JL95 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Prg3Q9JL95 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Prg3Q9JL95 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Prg3Q9JL95 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
Prg3Q9JL95 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Prg3Q9JL95 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Prg3Q9JL95 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Prg3Q9JL95 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Prg3Q9JL95 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Prg3Q9JL95 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.9 ms