Protein–RNA interactions for Protein: Q9JK83

Pard6b, Partitioning defective 6 homolog beta, mousemouse

Predictions only

Length 371 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pard6bQ9JK83 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Pard6bQ9JK83 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Pard6bQ9JK83 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Pard6bQ9JK83 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Pard6bQ9JK83 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Pard6bQ9JK83 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Pard6bQ9JK83 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Pard6bQ9JK83 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Pard6bQ9JK83 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Pard6bQ9JK83 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Pard6bQ9JK83 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Pard6bQ9JK83 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Pard6bQ9JK83 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Pard6bQ9JK83 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Pard6bQ9JK83 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Pard6bQ9JK83 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Pard6bQ9JK83 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Pard6bQ9JK83 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Pard6bQ9JK83 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Pard6bQ9JK83 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Pard6bQ9JK83 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Pard6bQ9JK83 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Pard6bQ9JK83 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Pard6bQ9JK83 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Pard6bQ9JK83 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Pard6bQ9JK83 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Pard6bQ9JK83 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Pard6bQ9JK83 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Pard6bQ9JK83 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Pard6bQ9JK83 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.15
Pard6bQ9JK83 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Pard6bQ9JK83 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Pard6bQ9JK83 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Pard6bQ9JK83 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Pard6bQ9JK83 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Pard6bQ9JK83 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Pard6bQ9JK83 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Pard6bQ9JK83 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Pard6bQ9JK83 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Pard6bQ9JK83 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Pard6bQ9JK83 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Pard6bQ9JK83 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Pard6bQ9JK83 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Pard6bQ9JK83 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Pard6bQ9JK83 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Pard6bQ9JK83 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Pard6bQ9JK83 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pard6bQ9JK83 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pard6bQ9JK83 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pard6bQ9JK83 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pard6bQ9JK83 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pard6bQ9JK83 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Pard6bQ9JK83 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Pard6bQ9JK83 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Pard6bQ9JK83 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Pard6bQ9JK83 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Pard6bQ9JK83 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Pard6bQ9JK83 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Pard6bQ9JK83 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Pard6bQ9JK83 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Pard6bQ9JK83 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Pard6bQ9JK83 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Pard6bQ9JK83 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Pard6bQ9JK83 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Pard6bQ9JK83 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Pard6bQ9JK83 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Pard6bQ9JK83 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Pard6bQ9JK83 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Pard6bQ9JK83 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Pard6bQ9JK83 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Pard6bQ9JK83 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Pard6bQ9JK83 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Pard6bQ9JK83 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Pard6bQ9JK83 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Pard6bQ9JK83 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Pard6bQ9JK83 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pard6bQ9JK83 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pard6bQ9JK83 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pard6bQ9JK83 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Pard6bQ9JK83 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Pard6bQ9JK83 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Pard6bQ9JK83 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Pard6bQ9JK83 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Pard6bQ9JK83 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Pard6bQ9JK83 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Pard6bQ9JK83 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Pard6bQ9JK83 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Pard6bQ9JK83 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Pard6bQ9JK83 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Pard6bQ9JK83 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Pard6bQ9JK83 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Pard6bQ9JK83 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Pard6bQ9JK83 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Pard6bQ9JK83 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Pard6bQ9JK83 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Pard6bQ9JK83 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Pard6bQ9JK83 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Pard6bQ9JK83 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Pard6bQ9JK83 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Pard6bQ9JK83 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.8 ms