Protein–RNA interactions for Protein: Q9JK48

Sh3glb1, Endophilin-B1, mousemouse

Predictions only

Length 365 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3glb1Q9JK48 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Sh3glb1Q9JK48 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Sh3glb1Q9JK48 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Sh3glb1Q9JK48 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Sh3glb1Q9JK48 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Sh3glb1Q9JK48 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Sh3glb1Q9JK48 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Sh3glb1Q9JK48 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Sh3glb1Q9JK48 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Sh3glb1Q9JK48 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Sh3glb1Q9JK48 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Sh3glb1Q9JK48 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Sh3glb1Q9JK48 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Sh3glb1Q9JK48 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Sh3glb1Q9JK48 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Sh3glb1Q9JK48 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Sh3glb1Q9JK48 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Sh3glb1Q9JK48 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Sh3glb1Q9JK48 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Sh3glb1Q9JK48 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Sh3glb1Q9JK48 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Sh3glb1Q9JK48 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Sh3glb1Q9JK48 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Sh3glb1Q9JK48 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Sh3glb1Q9JK48 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
Sh3glb1Q9JK48 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Sh3glb1Q9JK48 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Sh3glb1Q9JK48 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Sh3glb1Q9JK48 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Sh3glb1Q9JK48 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Sh3glb1Q9JK48 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Sh3glb1Q9JK48 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Sh3glb1Q9JK48 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Sh3glb1Q9JK48 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Sh3glb1Q9JK48 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Sh3glb1Q9JK48 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Sh3glb1Q9JK48 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Sh3glb1Q9JK48 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Sh3glb1Q9JK48 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Sh3glb1Q9JK48 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Sh3glb1Q9JK48 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
Sh3glb1Q9JK48 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Sh3glb1Q9JK48 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Sh3glb1Q9JK48 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Sh3glb1Q9JK48 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Sh3glb1Q9JK48 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Sh3glb1Q9JK48 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Sh3glb1Q9JK48 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Sh3glb1Q9JK48 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Sh3glb1Q9JK48 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Sh3glb1Q9JK48 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Sh3glb1Q9JK48 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Sh3glb1Q9JK48 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Sh3glb1Q9JK48 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Sh3glb1Q9JK48 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Sh3glb1Q9JK48 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Sh3glb1Q9JK48 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Sh3glb1Q9JK48 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Sh3glb1Q9JK48 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Sh3glb1Q9JK48 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Sh3glb1Q9JK48 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Sh3glb1Q9JK48 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Sh3glb1Q9JK48 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Sh3glb1Q9JK48 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Sh3glb1Q9JK48 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Sh3glb1Q9JK48 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Sh3glb1Q9JK48 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Sh3glb1Q9JK48 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Sh3glb1Q9JK48 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Sh3glb1Q9JK48 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Sh3glb1Q9JK48 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Sh3glb1Q9JK48 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Sh3glb1Q9JK48 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Sh3glb1Q9JK48 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Sh3glb1Q9JK48 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Sh3glb1Q9JK48 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Sh3glb1Q9JK48 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Sh3glb1Q9JK48 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Sh3glb1Q9JK48 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Sh3glb1Q9JK48 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Sh3glb1Q9JK48 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Sh3glb1Q9JK48 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Sh3glb1Q9JK48 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Sh3glb1Q9JK48 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Sh3glb1Q9JK48 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Sh3glb1Q9JK48 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Sh3glb1Q9JK48 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Sh3glb1Q9JK48 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Sh3glb1Q9JK48 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Sh3glb1Q9JK48 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Sh3glb1Q9JK48 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Sh3glb1Q9JK48 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Sh3glb1Q9JK48 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Sh3glb1Q9JK48 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Sh3glb1Q9JK48 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Sh3glb1Q9JK48 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Sh3glb1Q9JK48 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Sh3glb1Q9JK48 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Sh3glb1Q9JK48 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Sh3glb1Q9JK48 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.5 ms