Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJR7

Ascl3, Achaete-scute homolog 3, mousemouse

Predictions only

Length 174 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ascl3Q9JJR7 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ascl3Q9JJR7 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ascl3Q9JJR7 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ascl3Q9JJR7 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ascl3Q9JJR7 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ascl3Q9JJR7 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ascl3Q9JJR7 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ascl3Q9JJR7 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ascl3Q9JJR7 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ascl3Q9JJR7 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ascl3Q9JJR7 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ascl3Q9JJR7 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ascl3Q9JJR7 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ascl3Q9JJR7 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ascl3Q9JJR7 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ascl3Q9JJR7 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ascl3Q9JJR7 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ascl3Q9JJR7 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ascl3Q9JJR7 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ascl3Q9JJR7 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ascl3Q9JJR7 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ascl3Q9JJR7 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ascl3Q9JJR7 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ascl3Q9JJR7 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ascl3Q9JJR7 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ascl3Q9JJR7 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ascl3Q9JJR7 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ascl3Q9JJR7 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ascl3Q9JJR7 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ascl3Q9JJR7 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ascl3Q9JJR7 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ascl3Q9JJR7 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Ascl3Q9JJR7 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ascl3Q9JJR7 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ascl3Q9JJR7 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ascl3Q9JJR7 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ascl3Q9JJR7 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Ascl3Q9JJR7 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ascl3Q9JJR7 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ascl3Q9JJR7 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ascl3Q9JJR7 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ascl3Q9JJR7 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ascl3Q9JJR7 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ascl3Q9JJR7 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ascl3Q9JJR7 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ascl3Q9JJR7 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ascl3Q9JJR7 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ascl3Q9JJR7 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ascl3Q9JJR7 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Ascl3Q9JJR7 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ascl3Q9JJR7 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ascl3Q9JJR7 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ascl3Q9JJR7 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ascl3Q9JJR7 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ascl3Q9JJR7 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ascl3Q9JJR7 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ascl3Q9JJR7 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ascl3Q9JJR7 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ascl3Q9JJR7 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ascl3Q9JJR7 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ascl3Q9JJR7 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ascl3Q9JJR7 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Ascl3Q9JJR7 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ascl3Q9JJR7 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ascl3Q9JJR7 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ascl3Q9JJR7 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ascl3Q9JJR7 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ascl3Q9JJR7 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ascl3Q9JJR7 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Ascl3Q9JJR7 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ascl3Q9JJR7 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ascl3Q9JJR7 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ascl3Q9JJR7 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ascl3Q9JJR7 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ascl3Q9JJR7 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ascl3Q9JJR7 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ascl3Q9JJR7 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ascl3Q9JJR7 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Ascl3Q9JJR7 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ascl3Q9JJR7 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ascl3Q9JJR7 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ascl3Q9JJR7 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ascl3Q9JJR7 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Ascl3Q9JJR7 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ascl3Q9JJR7 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Ascl3Q9JJR7 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ascl3Q9JJR7 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ascl3Q9JJR7 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ascl3Q9JJR7 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Ascl3Q9JJR7 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ascl3Q9JJR7 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ascl3Q9JJR7 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ascl3Q9JJR7 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ascl3Q9JJR7 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ascl3Q9JJR7 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ascl3Q9JJR7 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Ascl3Q9JJR7 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Ascl3Q9JJR7 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ascl3Q9JJR7 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Ascl3Q9JJR7 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.2 ms