Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJN5

Cpn1, Carboxypeptidase N catalytic chain, mousemouse

Predictions only

Length 457 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpn1Q9JJN5 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cpn1Q9JJN5 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cpn1Q9JJN5 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cpn1Q9JJN5 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cpn1Q9JJN5 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cpn1Q9JJN5 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cpn1Q9JJN5 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cpn1Q9JJN5 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cpn1Q9JJN5 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cpn1Q9JJN5 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cpn1Q9JJN5 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cpn1Q9JJN5 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cpn1Q9JJN5 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cpn1Q9JJN5 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cpn1Q9JJN5 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cpn1Q9JJN5 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cpn1Q9JJN5 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cpn1Q9JJN5 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cpn1Q9JJN5 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cpn1Q9JJN5 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cpn1Q9JJN5 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cpn1Q9JJN5 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cpn1Q9JJN5 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cpn1Q9JJN5 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cpn1Q9JJN5 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cpn1Q9JJN5 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Cpn1Q9JJN5 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Cpn1Q9JJN5 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Cpn1Q9JJN5 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Cpn1Q9JJN5 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Cpn1Q9JJN5 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Cpn1Q9JJN5 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Cpn1Q9JJN5 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Cpn1Q9JJN5 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Cpn1Q9JJN5 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Cpn1Q9JJN5 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Cpn1Q9JJN5 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Cpn1Q9JJN5 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Cpn1Q9JJN5 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Cpn1Q9JJN5 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Cpn1Q9JJN5 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Cpn1Q9JJN5 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cpn1Q9JJN5 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cpn1Q9JJN5 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cpn1Q9JJN5 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cpn1Q9JJN5 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cpn1Q9JJN5 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cpn1Q9JJN5 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cpn1Q9JJN5 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cpn1Q9JJN5 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cpn1Q9JJN5 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cpn1Q9JJN5 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cpn1Q9JJN5 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cpn1Q9JJN5 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cpn1Q9JJN5 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cpn1Q9JJN5 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cpn1Q9JJN5 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cpn1Q9JJN5 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cpn1Q9JJN5 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cpn1Q9JJN5 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cpn1Q9JJN5 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cpn1Q9JJN5 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cpn1Q9JJN5 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cpn1Q9JJN5 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cpn1Q9JJN5 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cpn1Q9JJN5 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cpn1Q9JJN5 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Cpn1Q9JJN5 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Cpn1Q9JJN5 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Cpn1Q9JJN5 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Cpn1Q9JJN5 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Cpn1Q9JJN5 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Cpn1Q9JJN5 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Cpn1Q9JJN5 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Cpn1Q9JJN5 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Cpn1Q9JJN5 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cpn1Q9JJN5 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Cpn1Q9JJN5 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cpn1Q9JJN5 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cpn1Q9JJN5 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cpn1Q9JJN5 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cpn1Q9JJN5 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cpn1Q9JJN5 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cpn1Q9JJN5 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cpn1Q9JJN5 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Cpn1Q9JJN5 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Cpn1Q9JJN5 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Cpn1Q9JJN5 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Cpn1Q9JJN5 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Cpn1Q9JJN5 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Cpn1Q9JJN5 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Cpn1Q9JJN5 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Cpn1Q9JJN5 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Cpn1Q9JJN5 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Cpn1Q9JJN5 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Cpn1Q9JJN5 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Cpn1Q9JJN5 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Cpn1Q9JJN5 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Cpn1Q9JJN5 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Cpn1Q9JJN5 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.3 ms