Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJN4

Oxct2a, Succinyl-CoA:3-ketoacid coenzyme A transferase 2A, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 520 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Oxct2aQ9JJN4 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Oxct2aQ9JJN4 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Oxct2aQ9JJN4 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Oxct2aQ9JJN4 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Oxct2aQ9JJN4 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Oxct2aQ9JJN4 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Oxct2aQ9JJN4 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Oxct2aQ9JJN4 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Oxct2aQ9JJN4 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Oxct2aQ9JJN4 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Oxct2aQ9JJN4 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Oxct2aQ9JJN4 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Oxct2aQ9JJN4 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Oxct2aQ9JJN4 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Oxct2aQ9JJN4 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Oxct2aQ9JJN4 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Oxct2aQ9JJN4 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Oxct2aQ9JJN4 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Oxct2aQ9JJN4 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Oxct2aQ9JJN4 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Oxct2aQ9JJN4 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Oxct2aQ9JJN4 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Oxct2aQ9JJN4 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Oxct2aQ9JJN4 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Oxct2aQ9JJN4 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Oxct2aQ9JJN4 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Oxct2aQ9JJN4 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Oxct2aQ9JJN4 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Oxct2aQ9JJN4 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Oxct2aQ9JJN4 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Oxct2aQ9JJN4 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Oxct2aQ9JJN4 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Oxct2aQ9JJN4 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Oxct2aQ9JJN4 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Oxct2aQ9JJN4 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Oxct2aQ9JJN4 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Oxct2aQ9JJN4 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Oxct2aQ9JJN4 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Oxct2aQ9JJN4 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Oxct2aQ9JJN4 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Oxct2aQ9JJN4 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Oxct2aQ9JJN4 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Oxct2aQ9JJN4 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Oxct2aQ9JJN4 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Oxct2aQ9JJN4 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Oxct2aQ9JJN4 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Oxct2aQ9JJN4 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Oxct2aQ9JJN4 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Oxct2aQ9JJN4 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Oxct2aQ9JJN4 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Oxct2aQ9JJN4 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Oxct2aQ9JJN4 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Oxct2aQ9JJN4 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Oxct2aQ9JJN4 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Oxct2aQ9JJN4 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Oxct2aQ9JJN4 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Oxct2aQ9JJN4 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Oxct2aQ9JJN4 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Oxct2aQ9JJN4 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Oxct2aQ9JJN4 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Oxct2aQ9JJN4 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Oxct2aQ9JJN4 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Oxct2aQ9JJN4 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Oxct2aQ9JJN4 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Oxct2aQ9JJN4 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Oxct2aQ9JJN4 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Oxct2aQ9JJN4 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Oxct2aQ9JJN4 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Oxct2aQ9JJN4 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Oxct2aQ9JJN4 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Oxct2aQ9JJN4 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Oxct2aQ9JJN4 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Oxct2aQ9JJN4 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Oxct2aQ9JJN4 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Oxct2aQ9JJN4 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Oxct2aQ9JJN4 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Oxct2aQ9JJN4 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Oxct2aQ9JJN4 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Oxct2aQ9JJN4 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Oxct2aQ9JJN4 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Oxct2aQ9JJN4 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Oxct2aQ9JJN4 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Oxct2aQ9JJN4 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Oxct2aQ9JJN4 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Oxct2aQ9JJN4 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Oxct2aQ9JJN4 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Oxct2aQ9JJN4 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Oxct2aQ9JJN4 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Oxct2aQ9JJN4 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Oxct2aQ9JJN4 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Oxct2aQ9JJN4 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Oxct2aQ9JJN4 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Oxct2aQ9JJN4 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Oxct2aQ9JJN4 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Oxct2aQ9JJN4 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Oxct2aQ9JJN4 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Oxct2aQ9JJN4 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Oxct2aQ9JJN4 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Oxct2aQ9JJN4 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Oxct2aQ9JJN4 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms