Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIF7

Copb1, Coatomer subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 953 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Copb1Q9JIF7 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Copb1Q9JIF7 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Copb1Q9JIF7 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Copb1Q9JIF7 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Copb1Q9JIF7 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Copb1Q9JIF7 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Copb1Q9JIF7 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Copb1Q9JIF7 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Copb1Q9JIF7 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Copb1Q9JIF7 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Copb1Q9JIF7 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Copb1Q9JIF7 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Copb1Q9JIF7 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Copb1Q9JIF7 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Copb1Q9JIF7 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Copb1Q9JIF7 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Copb1Q9JIF7 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Copb1Q9JIF7 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Copb1Q9JIF7 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Copb1Q9JIF7 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Copb1Q9JIF7 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Copb1Q9JIF7 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Copb1Q9JIF7 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Copb1Q9JIF7 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Copb1Q9JIF7 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Copb1Q9JIF7 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Copb1Q9JIF7 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Copb1Q9JIF7 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Copb1Q9JIF7 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Copb1Q9JIF7 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Copb1Q9JIF7 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Copb1Q9JIF7 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Copb1Q9JIF7 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Copb1Q9JIF7 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Copb1Q9JIF7 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Copb1Q9JIF7 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Copb1Q9JIF7 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Copb1Q9JIF7 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Copb1Q9JIF7 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Copb1Q9JIF7 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Copb1Q9JIF7 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Copb1Q9JIF7 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Copb1Q9JIF7 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Copb1Q9JIF7 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Copb1Q9JIF7 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Copb1Q9JIF7 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Copb1Q9JIF7 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Copb1Q9JIF7 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Copb1Q9JIF7 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
Copb1Q9JIF7 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Copb1Q9JIF7 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Copb1Q9JIF7 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Copb1Q9JIF7 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Copb1Q9JIF7 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Copb1Q9JIF7 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Copb1Q9JIF7 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Copb1Q9JIF7 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Copb1Q9JIF7 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Copb1Q9JIF7 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Copb1Q9JIF7 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Copb1Q9JIF7 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Copb1Q9JIF7 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Copb1Q9JIF7 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Copb1Q9JIF7 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Copb1Q9JIF7 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Copb1Q9JIF7 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Copb1Q9JIF7 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Copb1Q9JIF7 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Copb1Q9JIF7 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Copb1Q9JIF7 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Copb1Q9JIF7 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Copb1Q9JIF7 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Copb1Q9JIF7 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Copb1Q9JIF7 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Copb1Q9JIF7 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Copb1Q9JIF7 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Copb1Q9JIF7 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Copb1Q9JIF7 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Copb1Q9JIF7 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Copb1Q9JIF7 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Copb1Q9JIF7 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Copb1Q9JIF7 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Copb1Q9JIF7 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Copb1Q9JIF7 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Copb1Q9JIF7 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Copb1Q9JIF7 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Copb1Q9JIF7 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Copb1Q9JIF7 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Copb1Q9JIF7 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Copb1Q9JIF7 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Copb1Q9JIF7 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Copb1Q9JIF7 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Copb1Q9JIF7 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Copb1Q9JIF7 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Copb1Q9JIF7 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Copb1Q9JIF7 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Copb1Q9JIF7 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Copb1Q9JIF7 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Copb1Q9JIF7 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Copb1Q9JIF7 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.5 ms