Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIF0

Prmt1, Protein arginine N-methyltransferase 1, mousemouse

Predictions only

Length 371 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prmt1Q9JIF0 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Prmt1Q9JIF0 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Prmt1Q9JIF0 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Prmt1Q9JIF0 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Prmt1Q9JIF0 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Prmt1Q9JIF0 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Prmt1Q9JIF0 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Prmt1Q9JIF0 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Prmt1Q9JIF0 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Prmt1Q9JIF0 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Prmt1Q9JIF0 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Prmt1Q9JIF0 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Prmt1Q9JIF0 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Prmt1Q9JIF0 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Prmt1Q9JIF0 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Prmt1Q9JIF0 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Prmt1Q9JIF0 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Prmt1Q9JIF0 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Prmt1Q9JIF0 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Prmt1Q9JIF0 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Prmt1Q9JIF0 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Prmt1Q9JIF0 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Prmt1Q9JIF0 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Prmt1Q9JIF0 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Prmt1Q9JIF0 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Prmt1Q9JIF0 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Prmt1Q9JIF0 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Prmt1Q9JIF0 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Prmt1Q9JIF0 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Prmt1Q9JIF0 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Prmt1Q9JIF0 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Prmt1Q9JIF0 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Prmt1Q9JIF0 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Prmt1Q9JIF0 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Prmt1Q9JIF0 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Prmt1Q9JIF0 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Prmt1Q9JIF0 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Prmt1Q9JIF0 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Prmt1Q9JIF0 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Prmt1Q9JIF0 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Prmt1Q9JIF0 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Prmt1Q9JIF0 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Prmt1Q9JIF0 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Prmt1Q9JIF0 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Prmt1Q9JIF0 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Prmt1Q9JIF0 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Prmt1Q9JIF0 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Prmt1Q9JIF0 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Prmt1Q9JIF0 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Prmt1Q9JIF0 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Prmt1Q9JIF0 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Prmt1Q9JIF0 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Prmt1Q9JIF0 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Prmt1Q9JIF0 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Prmt1Q9JIF0 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Prmt1Q9JIF0 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Prmt1Q9JIF0 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Prmt1Q9JIF0 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Prmt1Q9JIF0 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Prmt1Q9JIF0 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Prmt1Q9JIF0 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Prmt1Q9JIF0 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Prmt1Q9JIF0 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Prmt1Q9JIF0 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Prmt1Q9JIF0 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Prmt1Q9JIF0 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Prmt1Q9JIF0 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Prmt1Q9JIF0 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Prmt1Q9JIF0 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Prmt1Q9JIF0 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Prmt1Q9JIF0 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Prmt1Q9JIF0 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Prmt1Q9JIF0 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Prmt1Q9JIF0 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Prmt1Q9JIF0 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Prmt1Q9JIF0 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Prmt1Q9JIF0 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Prmt1Q9JIF0 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Prmt1Q9JIF0 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Prmt1Q9JIF0 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Prmt1Q9JIF0 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Prmt1Q9JIF0 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Prmt1Q9JIF0 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Prmt1Q9JIF0 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Prmt1Q9JIF0 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Prmt1Q9JIF0 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Prmt1Q9JIF0 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Prmt1Q9JIF0 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Prmt1Q9JIF0 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Prmt1Q9JIF0 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Prmt1Q9JIF0 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Prmt1Q9JIF0 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Prmt1Q9JIF0 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Prmt1Q9JIF0 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Prmt1Q9JIF0 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Prmt1Q9JIF0 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Prmt1Q9JIF0 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Prmt1Q9JIF0 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Prmt1Q9JIF0 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Prmt1Q9JIF0 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 117.3 ms