Protein–RNA interactions for Protein: Q9JHW9

Aldh1a3, Aldehyde dehydrogenase family 1 member A3, mousemouse

Predictions only

Length 512 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Aldh1a3Q9JHW9 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Aldh1a3Q9JHW9 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Aldh1a3Q9JHW9 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Aldh1a3Q9JHW9 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Aldh1a3Q9JHW9 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Aldh1a3Q9JHW9 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Aldh1a3Q9JHW9 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Aldh1a3Q9JHW9 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Aldh1a3Q9JHW9 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Aldh1a3Q9JHW9 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Aldh1a3Q9JHW9 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Aldh1a3Q9JHW9 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Aldh1a3Q9JHW9 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Aldh1a3Q9JHW9 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Aldh1a3Q9JHW9 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Aldh1a3Q9JHW9 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Aldh1a3Q9JHW9 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Aldh1a3Q9JHW9 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Aldh1a3Q9JHW9 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Aldh1a3Q9JHW9 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Aldh1a3Q9JHW9 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Aldh1a3Q9JHW9 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Aldh1a3Q9JHW9 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Aldh1a3Q9JHW9 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Aldh1a3Q9JHW9 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Aldh1a3Q9JHW9 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Aldh1a3Q9JHW9 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Aldh1a3Q9JHW9 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Aldh1a3Q9JHW9 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Aldh1a3Q9JHW9 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Aldh1a3Q9JHW9 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Aldh1a3Q9JHW9 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Aldh1a3Q9JHW9 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Aldh1a3Q9JHW9 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Aldh1a3Q9JHW9 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Aldh1a3Q9JHW9 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Aldh1a3Q9JHW9 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Aldh1a3Q9JHW9 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Aldh1a3Q9JHW9 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Aldh1a3Q9JHW9 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Aldh1a3Q9JHW9 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Aldh1a3Q9JHW9 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Aldh1a3Q9JHW9 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Aldh1a3Q9JHW9 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Aldh1a3Q9JHW9 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Aldh1a3Q9JHW9 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Aldh1a3Q9JHW9 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Aldh1a3Q9JHW9 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Aldh1a3Q9JHW9 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Aldh1a3Q9JHW9 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Aldh1a3Q9JHW9 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Aldh1a3Q9JHW9 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Aldh1a3Q9JHW9 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Aldh1a3Q9JHW9 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Aldh1a3Q9JHW9 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Aldh1a3Q9JHW9 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Aldh1a3Q9JHW9 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Aldh1a3Q9JHW9 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Aldh1a3Q9JHW9 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Aldh1a3Q9JHW9 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Aldh1a3Q9JHW9 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Aldh1a3Q9JHW9 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Aldh1a3Q9JHW9 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Aldh1a3Q9JHW9 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Aldh1a3Q9JHW9 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Aldh1a3Q9JHW9 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Aldh1a3Q9JHW9 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Aldh1a3Q9JHW9 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Aldh1a3Q9JHW9 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Aldh1a3Q9JHW9 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Aldh1a3Q9JHW9 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Aldh1a3Q9JHW9 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Aldh1a3Q9JHW9 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Aldh1a3Q9JHW9 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Aldh1a3Q9JHW9 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Aldh1a3Q9JHW9 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Aldh1a3Q9JHW9 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Aldh1a3Q9JHW9 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Aldh1a3Q9JHW9 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Aldh1a3Q9JHW9 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Aldh1a3Q9JHW9 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Aldh1a3Q9JHW9 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Aldh1a3Q9JHW9 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Aldh1a3Q9JHW9 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Aldh1a3Q9JHW9 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Aldh1a3Q9JHW9 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Aldh1a3Q9JHW9 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Aldh1a3Q9JHW9 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Aldh1a3Q9JHW9 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Aldh1a3Q9JHW9 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Aldh1a3Q9JHW9 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Aldh1a3Q9JHW9 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Aldh1a3Q9JHW9 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Aldh1a3Q9JHW9 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Aldh1a3Q9JHW9 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Aldh1a3Q9JHW9 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Aldh1a3Q9JHW9 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Aldh1a3Q9JHW9 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Aldh1a3Q9JHW9 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Aldh1a3Q9JHW9 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms