Protein–RNA interactions for Protein: Q9ES56

Trappc4, Trafficking protein particle complex subunit 4, mousemouse

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc4Q9ES56 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Trappc4Q9ES56 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Trappc4Q9ES56 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Trappc4Q9ES56 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Trappc4Q9ES56 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Trappc4Q9ES56 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Trappc4Q9ES56 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Trappc4Q9ES56 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Trappc4Q9ES56 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Trappc4Q9ES56 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Trappc4Q9ES56 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Trappc4Q9ES56 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Trappc4Q9ES56 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Trappc4Q9ES56 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Trappc4Q9ES56 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Trappc4Q9ES56 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Trappc4Q9ES56 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Trappc4Q9ES56 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Trappc4Q9ES56 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Trappc4Q9ES56 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Trappc4Q9ES56 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Trappc4Q9ES56 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Trappc4Q9ES56 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Trappc4Q9ES56 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Trappc4Q9ES56 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Trappc4Q9ES56 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Trappc4Q9ES56 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Trappc4Q9ES56 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Trappc4Q9ES56 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Trappc4Q9ES56 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Trappc4Q9ES56 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Trappc4Q9ES56 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Trappc4Q9ES56 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Trappc4Q9ES56 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Trappc4Q9ES56 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Trappc4Q9ES56 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Trappc4Q9ES56 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Trappc4Q9ES56 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Trappc4Q9ES56 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Trappc4Q9ES56 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Trappc4Q9ES56 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Trappc4Q9ES56 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Trappc4Q9ES56 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Trappc4Q9ES56 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Trappc4Q9ES56 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Trappc4Q9ES56 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Trappc4Q9ES56 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Trappc4Q9ES56 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Trappc4Q9ES56 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Trappc4Q9ES56 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Trappc4Q9ES56 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Trappc4Q9ES56 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Trappc4Q9ES56 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Trappc4Q9ES56 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Trappc4Q9ES56 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Trappc4Q9ES56 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Trappc4Q9ES56 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Trappc4Q9ES56 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Trappc4Q9ES56 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Trappc4Q9ES56 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Trappc4Q9ES56 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Trappc4Q9ES56 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Trappc4Q9ES56 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Trappc4Q9ES56 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Trappc4Q9ES56 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Trappc4Q9ES56 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Trappc4Q9ES56 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Trappc4Q9ES56 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Trappc4Q9ES56 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Trappc4Q9ES56 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Trappc4Q9ES56 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Trappc4Q9ES56 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Trappc4Q9ES56 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Trappc4Q9ES56 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Trappc4Q9ES56 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Trappc4Q9ES56 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Trappc4Q9ES56 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Trappc4Q9ES56 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Trappc4Q9ES56 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Trappc4Q9ES56 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Trappc4Q9ES56 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Trappc4Q9ES56 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Trappc4Q9ES56 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Trappc4Q9ES56 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Trappc4Q9ES56 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Trappc4Q9ES56 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Trappc4Q9ES56 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Trappc4Q9ES56 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Trappc4Q9ES56 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Trappc4Q9ES56 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Trappc4Q9ES56 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Trappc4Q9ES56 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Trappc4Q9ES56 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Trappc4Q9ES56 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Trappc4Q9ES56 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Trappc4Q9ES56 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Trappc4Q9ES56 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Trappc4Q9ES56 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Trappc4Q9ES56 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Trappc4Q9ES56 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 79.1 ms