Protein–RNA interactions for Protein: Q9ES34

Ube3b, Ubiquitin-protein ligase E3B, mousemouse

Predictions only

Length 1,070 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube3bQ9ES34 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Ube3bQ9ES34 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Ube3bQ9ES34 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Ube3bQ9ES34 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Ube3bQ9ES34 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Ube3bQ9ES34 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Ube3bQ9ES34 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Ube3bQ9ES34 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
Ube3bQ9ES34 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Ube3bQ9ES34 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Ube3bQ9ES34 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Ube3bQ9ES34 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Ube3bQ9ES34 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Ube3bQ9ES34 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Ube3bQ9ES34 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Ube3bQ9ES34 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Ube3bQ9ES34 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Ube3bQ9ES34 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Ube3bQ9ES34 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Ube3bQ9ES34 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Ube3bQ9ES34 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Ube3bQ9ES34 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Ube3bQ9ES34 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Ube3bQ9ES34 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Ube3bQ9ES34 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Ube3bQ9ES34 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Ube3bQ9ES34 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Ube3bQ9ES34 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Ube3bQ9ES34 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Ube3bQ9ES34 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Ube3bQ9ES34 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Ube3bQ9ES34 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Ube3bQ9ES34 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Ube3bQ9ES34 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Ube3bQ9ES34 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Ube3bQ9ES34 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
Ube3bQ9ES34 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Ube3bQ9ES34 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Ube3bQ9ES34 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Ube3bQ9ES34 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Ube3bQ9ES34 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Ube3bQ9ES34 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Ube3bQ9ES34 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Ube3bQ9ES34 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Ube3bQ9ES34 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
Ube3bQ9ES34 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Ube3bQ9ES34 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Ube3bQ9ES34 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Ube3bQ9ES34 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Ube3bQ9ES34 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Ube3bQ9ES34 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Ube3bQ9ES34 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Ube3bQ9ES34 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Ube3bQ9ES34 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Ube3bQ9ES34 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Ube3bQ9ES34 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Ube3bQ9ES34 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Ube3bQ9ES34 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Ube3bQ9ES34 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Ube3bQ9ES34 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Ube3bQ9ES34 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Ube3bQ9ES34 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Ube3bQ9ES34 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Ube3bQ9ES34 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Ube3bQ9ES34 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Ube3bQ9ES34 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Ube3bQ9ES34 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Ube3bQ9ES34 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Ube3bQ9ES34 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Ube3bQ9ES34 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Ube3bQ9ES34 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
Ube3bQ9ES34 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Ube3bQ9ES34 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Ube3bQ9ES34 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Ube3bQ9ES34 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Ube3bQ9ES34 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Ube3bQ9ES34 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Ube3bQ9ES34 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Ube3bQ9ES34 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Ube3bQ9ES34 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Ube3bQ9ES34 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Ube3bQ9ES34 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Ube3bQ9ES34 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Ube3bQ9ES34 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
Ube3bQ9ES34 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Ube3bQ9ES34 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Ube3bQ9ES34 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Ube3bQ9ES34 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Ube3bQ9ES34 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Ube3bQ9ES34 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Ube3bQ9ES34 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Ube3bQ9ES34 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Ube3bQ9ES34 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Ube3bQ9ES34 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Ube3bQ9ES34 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
Ube3bQ9ES34 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Ube3bQ9ES34 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Ube3bQ9ES34 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Ube3bQ9ES34 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Ube3bQ9ES34 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 94 ms