Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQG9

Col4a3bp, Collagen type IV alpha-3-binding protein, mousemouse

Predictions only

Length 624 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col4a3bpQ9EQG9 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Col4a3bpQ9EQG9 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
Col4a3bpQ9EQG9 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Col4a3bpQ9EQG9 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Col4a3bpQ9EQG9 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Col4a3bpQ9EQG9 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Col4a3bpQ9EQG9 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Col4a3bpQ9EQG9 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Col4a3bpQ9EQG9 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Col4a3bpQ9EQG9 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Col4a3bpQ9EQG9 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Col4a3bpQ9EQG9 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Col4a3bpQ9EQG9 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Col4a3bpQ9EQG9 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Col4a3bpQ9EQG9 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Col4a3bpQ9EQG9 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Col4a3bpQ9EQG9 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Col4a3bpQ9EQG9 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Col4a3bpQ9EQG9 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Col4a3bpQ9EQG9 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Col4a3bpQ9EQG9 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Col4a3bpQ9EQG9 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Col4a3bpQ9EQG9 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Col4a3bpQ9EQG9 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Col4a3bpQ9EQG9 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Col4a3bpQ9EQG9 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Col4a3bpQ9EQG9 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Col4a3bpQ9EQG9 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Col4a3bpQ9EQG9 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Col4a3bpQ9EQG9 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
Col4a3bpQ9EQG9 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Col4a3bpQ9EQG9 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Col4a3bpQ9EQG9 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Col4a3bpQ9EQG9 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Col4a3bpQ9EQG9 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Col4a3bpQ9EQG9 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Col4a3bpQ9EQG9 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Col4a3bpQ9EQG9 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Col4a3bpQ9EQG9 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Col4a3bpQ9EQG9 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Col4a3bpQ9EQG9 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Col4a3bpQ9EQG9 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Col4a3bpQ9EQG9 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Col4a3bpQ9EQG9 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Col4a3bpQ9EQG9 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Col4a3bpQ9EQG9 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Col4a3bpQ9EQG9 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Col4a3bpQ9EQG9 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Col4a3bpQ9EQG9 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Col4a3bpQ9EQG9 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Col4a3bpQ9EQG9 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Col4a3bpQ9EQG9 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Col4a3bpQ9EQG9 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Col4a3bpQ9EQG9 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Col4a3bpQ9EQG9 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Col4a3bpQ9EQG9 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Col4a3bpQ9EQG9 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Col4a3bpQ9EQG9 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
Col4a3bpQ9EQG9 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Col4a3bpQ9EQG9 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Col4a3bpQ9EQG9 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Col4a3bpQ9EQG9 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
Col4a3bpQ9EQG9 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
Col4a3bpQ9EQG9 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Col4a3bpQ9EQG9 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Col4a3bpQ9EQG9 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
Col4a3bpQ9EQG9 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Col4a3bpQ9EQG9 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Col4a3bpQ9EQG9 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Col4a3bpQ9EQG9 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Col4a3bpQ9EQG9 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
Col4a3bpQ9EQG9 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Col4a3bpQ9EQG9 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Col4a3bpQ9EQG9 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Col4a3bpQ9EQG9 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Col4a3bpQ9EQG9 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Col4a3bpQ9EQG9 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Col4a3bpQ9EQG9 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Col4a3bpQ9EQG9 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Col4a3bpQ9EQG9 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Col4a3bpQ9EQG9 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Col4a3bpQ9EQG9 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Col4a3bpQ9EQG9 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Col4a3bpQ9EQG9 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Col4a3bpQ9EQG9 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Col4a3bpQ9EQG9 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Col4a3bpQ9EQG9 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
Col4a3bpQ9EQG9 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Col4a3bpQ9EQG9 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Col4a3bpQ9EQG9 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Col4a3bpQ9EQG9 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Col4a3bpQ9EQG9 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Col4a3bpQ9EQG9 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Col4a3bpQ9EQG9 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Col4a3bpQ9EQG9 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
Col4a3bpQ9EQG9 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Col4a3bpQ9EQG9 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Col4a3bpQ9EQG9 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Col4a3bpQ9EQG9 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Col4a3bpQ9EQG9 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.4 ms