Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCN7

Rnft1, E3 ubiquitin-protein ligase RNFT1, mousemouse

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Length 395 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Rnft1Q9DCN7 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
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Rnft1Q9DCN7 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Rnft1Q9DCN7 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Rnft1Q9DCN7 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Rnft1Q9DCN7 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Rnft1Q9DCN7 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Rnft1Q9DCN7 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
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Rnft1Q9DCN7 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
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Rnft1Q9DCN7 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
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Rnft1Q9DCN7 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
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Rnft1Q9DCN7 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
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Rnft1Q9DCN7 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
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Rnft1Q9DCN7 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Rnft1Q9DCN7 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
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Rnft1Q9DCN7 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rnft1Q9DCN7 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Rnft1Q9DCN7 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rnft1Q9DCN7 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Rnft1Q9DCN7 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Rnft1Q9DCN7 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
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Rnft1Q9DCN7 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
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Rnft1Q9DCN7 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
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Rnft1Q9DCN7 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Rnft1Q9DCN7 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
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Rnft1Q9DCN7 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
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Rnft1Q9DCN7 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rnft1Q9DCN7 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
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Rnft1Q9DCN7 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rnft1Q9DCN7 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rnft1Q9DCN7 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
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