Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBR1

Xrn2, 5'-3' exoribonuclease 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 951 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Xrn2Q9DBR1 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Xrn2Q9DBR1 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
Xrn2Q9DBR1 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Xrn2Q9DBR1 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Xrn2Q9DBR1 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
Xrn2Q9DBR1 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Xrn2Q9DBR1 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Xrn2Q9DBR1 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Xrn2Q9DBR1 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Xrn2Q9DBR1 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Xrn2Q9DBR1 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Xrn2Q9DBR1 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Xrn2Q9DBR1 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Xrn2Q9DBR1 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
Xrn2Q9DBR1 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Xrn2Q9DBR1 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Xrn2Q9DBR1 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Xrn2Q9DBR1 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Xrn2Q9DBR1 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Xrn2Q9DBR1 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Xrn2Q9DBR1 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Xrn2Q9DBR1 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Xrn2Q9DBR1 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Xrn2Q9DBR1 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Xrn2Q9DBR1 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Xrn2Q9DBR1 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Xrn2Q9DBR1 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Xrn2Q9DBR1 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Xrn2Q9DBR1 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Xrn2Q9DBR1 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Xrn2Q9DBR1 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Xrn2Q9DBR1 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Xrn2Q9DBR1 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Xrn2Q9DBR1 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Xrn2Q9DBR1 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Xrn2Q9DBR1 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Xrn2Q9DBR1 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Xrn2Q9DBR1 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Xrn2Q9DBR1 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Xrn2Q9DBR1 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Xrn2Q9DBR1 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Xrn2Q9DBR1 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Xrn2Q9DBR1 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Xrn2Q9DBR1 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Xrn2Q9DBR1 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Xrn2Q9DBR1 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Xrn2Q9DBR1 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Xrn2Q9DBR1 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Xrn2Q9DBR1 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Xrn2Q9DBR1 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
Xrn2Q9DBR1 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Xrn2Q9DBR1 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Xrn2Q9DBR1 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Xrn2Q9DBR1 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Xrn2Q9DBR1 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Xrn2Q9DBR1 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Xrn2Q9DBR1 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Xrn2Q9DBR1 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Xrn2Q9DBR1 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Xrn2Q9DBR1 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
Xrn2Q9DBR1 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Xrn2Q9DBR1 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Xrn2Q9DBR1 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Xrn2Q9DBR1 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Xrn2Q9DBR1 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Xrn2Q9DBR1 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Xrn2Q9DBR1 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Xrn2Q9DBR1 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Xrn2Q9DBR1 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Xrn2Q9DBR1 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Xrn2Q9DBR1 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Xrn2Q9DBR1 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Xrn2Q9DBR1 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Xrn2Q9DBR1 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Xrn2Q9DBR1 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Xrn2Q9DBR1 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Xrn2Q9DBR1 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Xrn2Q9DBR1 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Xrn2Q9DBR1 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Xrn2Q9DBR1 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Xrn2Q9DBR1 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Xrn2Q9DBR1 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Xrn2Q9DBR1 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Xrn2Q9DBR1 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
Xrn2Q9DBR1 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Xrn2Q9DBR1 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Xrn2Q9DBR1 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Xrn2Q9DBR1 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Xrn2Q9DBR1 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Xrn2Q9DBR1 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Xrn2Q9DBR1 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Xrn2Q9DBR1 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Xrn2Q9DBR1 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Xrn2Q9DBR1 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Xrn2Q9DBR1 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Xrn2Q9DBR1 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Xrn2Q9DBR1 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Xrn2Q9DBR1 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Xrn2Q9DBR1 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Xrn2Q9DBR1 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.9 ms