Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA42

Uncharacterized protein C20orf85 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 136 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9DA42 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Q9DA42 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Q9DA42 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Q9DA42 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Q9DA42 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Q9DA42 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Q9DA42 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Q9DA42 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Q9DA42 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Q9DA42 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Q9DA42 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Q9DA42 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Q9DA42 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Q9DA42 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Q9DA42 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Q9DA42 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Q9DA42 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Q9DA42 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Q9DA42 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Q9DA42 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Q9DA42 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Q9DA42 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Q9DA42 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Q9DA42 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Q9DA42 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Q9DA42 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Q9DA42 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Q9DA42 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Q9DA42 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Q9DA42 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Q9DA42 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Q9DA42 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Q9DA42 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Q9DA42 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Q9DA42 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Q9DA42 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Q9DA42 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Q9DA42 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Q9DA42 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Q9DA42 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Q9DA42 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Q9DA42 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Q9DA42 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Q9DA42 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Q9DA42 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Q9DA42 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Q9DA42 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Q9DA42 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Q9DA42 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Q9DA42 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Q9DA42 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Q9DA42 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Q9DA42 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Q9DA42 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Q9DA42 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Q9DA42 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Q9DA42 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Q9DA42 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Q9DA42 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Q9DA42 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Q9DA42 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Q9DA42 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Q9DA42 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Q9DA42 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Q9DA42 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Q9DA42 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Q9DA42 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Q9DA42 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Q9DA42 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Q9DA42 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Q9DA42 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Q9DA42 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Q9DA42 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Q9DA42 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Q9DA42 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Q9DA42 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Q9DA42 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Q9DA42 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Q9DA42 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Q9DA42 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Q9DA42 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Q9DA42 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Q9DA42 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Q9DA42 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Q9DA42 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Q9DA42 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Q9DA42 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Q9DA42 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Q9DA42 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Q9DA42 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Q9DA42 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Q9DA42 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Q9DA42 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Q9DA42 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Q9DA42 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Q9DA42 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Q9DA42 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Q9DA42 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Q9DA42 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Q9DA42 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.8 ms