Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7J7

Capns2, Calpain small subunit 2, mousemouse

Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capns2Q9D7J7 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Capns2Q9D7J7 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Capns2Q9D7J7 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Capns2Q9D7J7 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Capns2Q9D7J7 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Capns2Q9D7J7 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Capns2Q9D7J7 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Capns2Q9D7J7 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Capns2Q9D7J7 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Capns2Q9D7J7 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Capns2Q9D7J7 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Capns2Q9D7J7 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Capns2Q9D7J7 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Capns2Q9D7J7 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Capns2Q9D7J7 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Capns2Q9D7J7 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Capns2Q9D7J7 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Capns2Q9D7J7 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Capns2Q9D7J7 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Capns2Q9D7J7 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Capns2Q9D7J7 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Capns2Q9D7J7 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Capns2Q9D7J7 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Capns2Q9D7J7 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Capns2Q9D7J7 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Capns2Q9D7J7 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Capns2Q9D7J7 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Capns2Q9D7J7 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Capns2Q9D7J7 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Capns2Q9D7J7 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Capns2Q9D7J7 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Capns2Q9D7J7 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Capns2Q9D7J7 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Capns2Q9D7J7 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Capns2Q9D7J7 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Capns2Q9D7J7 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Capns2Q9D7J7 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Capns2Q9D7J7 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Capns2Q9D7J7 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Capns2Q9D7J7 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Capns2Q9D7J7 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Capns2Q9D7J7 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Capns2Q9D7J7 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Capns2Q9D7J7 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Capns2Q9D7J7 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Capns2Q9D7J7 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Capns2Q9D7J7 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Capns2Q9D7J7 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Capns2Q9D7J7 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Capns2Q9D7J7 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Capns2Q9D7J7 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Capns2Q9D7J7 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Capns2Q9D7J7 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Capns2Q9D7J7 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Capns2Q9D7J7 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Capns2Q9D7J7 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Capns2Q9D7J7 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Capns2Q9D7J7 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Capns2Q9D7J7 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Capns2Q9D7J7 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Capns2Q9D7J7 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Capns2Q9D7J7 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Capns2Q9D7J7 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Capns2Q9D7J7 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Capns2Q9D7J7 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Capns2Q9D7J7 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Capns2Q9D7J7 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Capns2Q9D7J7 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Capns2Q9D7J7 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Capns2Q9D7J7 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Capns2Q9D7J7 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Capns2Q9D7J7 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Capns2Q9D7J7 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Capns2Q9D7J7 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Capns2Q9D7J7 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Capns2Q9D7J7 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Capns2Q9D7J7 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Capns2Q9D7J7 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Capns2Q9D7J7 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Capns2Q9D7J7 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Capns2Q9D7J7 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Capns2Q9D7J7 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Capns2Q9D7J7 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Capns2Q9D7J7 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Capns2Q9D7J7 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Capns2Q9D7J7 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Capns2Q9D7J7 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Capns2Q9D7J7 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Capns2Q9D7J7 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Capns2Q9D7J7 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Capns2Q9D7J7 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Capns2Q9D7J7 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Capns2Q9D7J7 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Capns2Q9D7J7 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Capns2Q9D7J7 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Capns2Q9D7J7 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Capns2Q9D7J7 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Capns2Q9D7J7 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Capns2Q9D7J7 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Capns2Q9D7J7 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.3 ms