Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6Z1

Nop56, Nucleolar protein 56, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 580 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nop56Q9D6Z1 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Nop56Q9D6Z1 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Nop56Q9D6Z1 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Nop56Q9D6Z1 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Nop56Q9D6Z1 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Nop56Q9D6Z1 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Nop56Q9D6Z1 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Nop56Q9D6Z1 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Nop56Q9D6Z1 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Nop56Q9D6Z1 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Nop56Q9D6Z1 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Nop56Q9D6Z1 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Nop56Q9D6Z1 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Nop56Q9D6Z1 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Nop56Q9D6Z1 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Nop56Q9D6Z1 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Nop56Q9D6Z1 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Nop56Q9D6Z1 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Nop56Q9D6Z1 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Nop56Q9D6Z1 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Nop56Q9D6Z1 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Nop56Q9D6Z1 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Nop56Q9D6Z1 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Nop56Q9D6Z1 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Nop56Q9D6Z1 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Nop56Q9D6Z1 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Nop56Q9D6Z1 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Nop56Q9D6Z1 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Nop56Q9D6Z1 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Nop56Q9D6Z1 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Nop56Q9D6Z1 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Nop56Q9D6Z1 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Nop56Q9D6Z1 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Nop56Q9D6Z1 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Nop56Q9D6Z1 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Nop56Q9D6Z1 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Nop56Q9D6Z1 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Nop56Q9D6Z1 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Nop56Q9D6Z1 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Nop56Q9D6Z1 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Nop56Q9D6Z1 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Nop56Q9D6Z1 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Nop56Q9D6Z1 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Nop56Q9D6Z1 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Nop56Q9D6Z1 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Nop56Q9D6Z1 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Nop56Q9D6Z1 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Nop56Q9D6Z1 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Nop56Q9D6Z1 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Nop56Q9D6Z1 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Nop56Q9D6Z1 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Nop56Q9D6Z1 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Nop56Q9D6Z1 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Nop56Q9D6Z1 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Nop56Q9D6Z1 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Nop56Q9D6Z1 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Nop56Q9D6Z1 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Nop56Q9D6Z1 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Nop56Q9D6Z1 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Nop56Q9D6Z1 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Nop56Q9D6Z1 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Nop56Q9D6Z1 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Nop56Q9D6Z1 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Nop56Q9D6Z1 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Nop56Q9D6Z1 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Nop56Q9D6Z1 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Nop56Q9D6Z1 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Nop56Q9D6Z1 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Nop56Q9D6Z1 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Nop56Q9D6Z1 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Nop56Q9D6Z1 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Nop56Q9D6Z1 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Nop56Q9D6Z1 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Nop56Q9D6Z1 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Nop56Q9D6Z1 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Nop56Q9D6Z1 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Nop56Q9D6Z1 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Nop56Q9D6Z1 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Nop56Q9D6Z1 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Nop56Q9D6Z1 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Nop56Q9D6Z1 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Nop56Q9D6Z1 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Nop56Q9D6Z1 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Nop56Q9D6Z1 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Nop56Q9D6Z1 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Nop56Q9D6Z1 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Nop56Q9D6Z1 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Nop56Q9D6Z1 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Nop56Q9D6Z1 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Nop56Q9D6Z1 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Nop56Q9D6Z1 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Nop56Q9D6Z1 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Nop56Q9D6Z1 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Nop56Q9D6Z1 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Nop56Q9D6Z1 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Nop56Q9D6Z1 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Nop56Q9D6Z1 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Nop56Q9D6Z1 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Nop56Q9D6Z1 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Nop56Q9D6Z1 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
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