Protein–RNA interactions for Protein: Q9D5Y1

Ccdc39, Coiled-coil domain-containing protein 39, mousemouse

Predictions only

Length 937 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc39Q9D5Y1 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Ccdc39Q9D5Y1 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Ccdc39Q9D5Y1 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Ccdc39Q9D5Y1 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Ccdc39Q9D5Y1 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Ccdc39Q9D5Y1 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
Ccdc39Q9D5Y1 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Ccdc39Q9D5Y1 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Ccdc39Q9D5Y1 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
Ccdc39Q9D5Y1 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Ccdc39Q9D5Y1 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Ccdc39Q9D5Y1 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Ccdc39Q9D5Y1 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Ccdc39Q9D5Y1 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Ccdc39Q9D5Y1 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
Ccdc39Q9D5Y1 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Ccdc39Q9D5Y1 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Ccdc39Q9D5Y1 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Ccdc39Q9D5Y1 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Ccdc39Q9D5Y1 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Ccdc39Q9D5Y1 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Ccdc39Q9D5Y1 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Ccdc39Q9D5Y1 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Ccdc39Q9D5Y1 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Ccdc39Q9D5Y1 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Ccdc39Q9D5Y1 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Ccdc39Q9D5Y1 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Ccdc39Q9D5Y1 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Ccdc39Q9D5Y1 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Ccdc39Q9D5Y1 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Ccdc39Q9D5Y1 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Ccdc39Q9D5Y1 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Ccdc39Q9D5Y1 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Ccdc39Q9D5Y1 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Ccdc39Q9D5Y1 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Ccdc39Q9D5Y1 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Ccdc39Q9D5Y1 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Ccdc39Q9D5Y1 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Ccdc39Q9D5Y1 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Ccdc39Q9D5Y1 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Ccdc39Q9D5Y1 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Ccdc39Q9D5Y1 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Ccdc39Q9D5Y1 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Ccdc39Q9D5Y1 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Ccdc39Q9D5Y1 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Ccdc39Q9D5Y1 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Ccdc39Q9D5Y1 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Ccdc39Q9D5Y1 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Ccdc39Q9D5Y1 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Ccdc39Q9D5Y1 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Ccdc39Q9D5Y1 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Ccdc39Q9D5Y1 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Ccdc39Q9D5Y1 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Ccdc39Q9D5Y1 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Ccdc39Q9D5Y1 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Ccdc39Q9D5Y1 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Ccdc39Q9D5Y1 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Ccdc39Q9D5Y1 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Ccdc39Q9D5Y1 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Ccdc39Q9D5Y1 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.76
Ccdc39Q9D5Y1 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Ccdc39Q9D5Y1 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Ccdc39Q9D5Y1 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Ccdc39Q9D5Y1 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Ccdc39Q9D5Y1 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Ccdc39Q9D5Y1 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Ccdc39Q9D5Y1 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Ccdc39Q9D5Y1 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Ccdc39Q9D5Y1 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Ccdc39Q9D5Y1 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Ccdc39Q9D5Y1 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Ccdc39Q9D5Y1 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Ccdc39Q9D5Y1 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Ccdc39Q9D5Y1 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Ccdc39Q9D5Y1 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Ccdc39Q9D5Y1 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Ccdc39Q9D5Y1 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Ccdc39Q9D5Y1 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Ccdc39Q9D5Y1 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Ccdc39Q9D5Y1 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Ccdc39Q9D5Y1 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Ccdc39Q9D5Y1 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Ccdc39Q9D5Y1 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
Ccdc39Q9D5Y1 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Ccdc39Q9D5Y1 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Ccdc39Q9D5Y1 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Ccdc39Q9D5Y1 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Ccdc39Q9D5Y1 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Ccdc39Q9D5Y1 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Ccdc39Q9D5Y1 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Ccdc39Q9D5Y1 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Ccdc39Q9D5Y1 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Ccdc39Q9D5Y1 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Ccdc39Q9D5Y1 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Ccdc39Q9D5Y1 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Ccdc39Q9D5Y1 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Ccdc39Q9D5Y1 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Ccdc39Q9D5Y1 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Ccdc39Q9D5Y1 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Ccdc39Q9D5Y1 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.7 ms