Protein–RNA interactions for Protein: Q9D516

Ccdc130, Coiled-coil domain-containing protein 130, mousemouse

Predictions only

Length 385 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc130Q9D516 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ccdc130Q9D516 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Ccdc130Q9D516 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ccdc130Q9D516 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ccdc130Q9D516 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ccdc130Q9D516 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ccdc130Q9D516 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ccdc130Q9D516 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ccdc130Q9D516 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ccdc130Q9D516 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ccdc130Q9D516 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ccdc130Q9D516 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ccdc130Q9D516 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ccdc130Q9D516 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ccdc130Q9D516 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ccdc130Q9D516 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ccdc130Q9D516 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ccdc130Q9D516 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ccdc130Q9D516 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ccdc130Q9D516 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ccdc130Q9D516 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ccdc130Q9D516 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ccdc130Q9D516 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ccdc130Q9D516 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ccdc130Q9D516 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ccdc130Q9D516 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ccdc130Q9D516 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Ccdc130Q9D516 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ccdc130Q9D516 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ccdc130Q9D516 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Ccdc130Q9D516 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ccdc130Q9D516 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ccdc130Q9D516 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ccdc130Q9D516 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ccdc130Q9D516 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ccdc130Q9D516 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ccdc130Q9D516 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ccdc130Q9D516 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ccdc130Q9D516 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ccdc130Q9D516 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ccdc130Q9D516 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Ccdc130Q9D516 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ccdc130Q9D516 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ccdc130Q9D516 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ccdc130Q9D516 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ccdc130Q9D516 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Ccdc130Q9D516 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ccdc130Q9D516 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ccdc130Q9D516 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ccdc130Q9D516 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ccdc130Q9D516 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ccdc130Q9D516 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Ccdc130Q9D516 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Ccdc130Q9D516 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ccdc130Q9D516 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ccdc130Q9D516 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ccdc130Q9D516 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ccdc130Q9D516 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ccdc130Q9D516 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ccdc130Q9D516 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ccdc130Q9D516 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ccdc130Q9D516 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ccdc130Q9D516 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ccdc130Q9D516 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ccdc130Q9D516 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ccdc130Q9D516 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ccdc130Q9D516 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Ccdc130Q9D516 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ccdc130Q9D516 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ccdc130Q9D516 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ccdc130Q9D516 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ccdc130Q9D516 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ccdc130Q9D516 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Ccdc130Q9D516 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ccdc130Q9D516 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ccdc130Q9D516 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ccdc130Q9D516 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ccdc130Q9D516 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Ccdc130Q9D516 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ccdc130Q9D516 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ccdc130Q9D516 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ccdc130Q9D516 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ccdc130Q9D516 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ccdc130Q9D516 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC21.83■■□□□ 1.08
Ccdc130Q9D516 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Ccdc130Q9D516 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ccdc130Q9D516 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ccdc130Q9D516 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ccdc130Q9D516 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ccdc130Q9D516 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Ccdc130Q9D516 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ccdc130Q9D516 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ccdc130Q9D516 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ccdc130Q9D516 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ccdc130Q9D516 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ccdc130Q9D516 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ccdc130Q9D516 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ccdc130Q9D516 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ccdc130Q9D516 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ccdc130Q9D516 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 124.8 ms