Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4H2

Gcc1, GRIP and coiled-coil domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 778 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gcc1Q9D4H2 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
Gcc1Q9D4H2 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Gcc1Q9D4H2 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Gcc1Q9D4H2 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Gcc1Q9D4H2 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
Gcc1Q9D4H2 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Gcc1Q9D4H2 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Gcc1Q9D4H2 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Gcc1Q9D4H2 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Gcc1Q9D4H2 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Gcc1Q9D4H2 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Gcc1Q9D4H2 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Gcc1Q9D4H2 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Gcc1Q9D4H2 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Gcc1Q9D4H2 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Gcc1Q9D4H2 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Gcc1Q9D4H2 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Gcc1Q9D4H2 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Gcc1Q9D4H2 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Gcc1Q9D4H2 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Gcc1Q9D4H2 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Gcc1Q9D4H2 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Gcc1Q9D4H2 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Gcc1Q9D4H2 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Gcc1Q9D4H2 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
Gcc1Q9D4H2 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Gcc1Q9D4H2 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Gcc1Q9D4H2 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Gcc1Q9D4H2 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Gcc1Q9D4H2 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Gcc1Q9D4H2 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Gcc1Q9D4H2 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Gcc1Q9D4H2 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Gcc1Q9D4H2 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Gcc1Q9D4H2 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Gcc1Q9D4H2 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Gcc1Q9D4H2 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
Gcc1Q9D4H2 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Gcc1Q9D4H2 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.92
Gcc1Q9D4H2 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Gcc1Q9D4H2 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Gcc1Q9D4H2 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Gcc1Q9D4H2 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Gcc1Q9D4H2 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Gcc1Q9D4H2 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Gcc1Q9D4H2 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Gcc1Q9D4H2 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Gcc1Q9D4H2 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Gcc1Q9D4H2 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
Gcc1Q9D4H2 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Gcc1Q9D4H2 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Gcc1Q9D4H2 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Gcc1Q9D4H2 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Gcc1Q9D4H2 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Gcc1Q9D4H2 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Gcc1Q9D4H2 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Gcc1Q9D4H2 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Gcc1Q9D4H2 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Gcc1Q9D4H2 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Gcc1Q9D4H2 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Gcc1Q9D4H2 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Gcc1Q9D4H2 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Gcc1Q9D4H2 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
Gcc1Q9D4H2 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Gcc1Q9D4H2 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Gcc1Q9D4H2 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Gcc1Q9D4H2 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
Gcc1Q9D4H2 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Gcc1Q9D4H2 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC27■■□□□ 1.91
Gcc1Q9D4H2 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Gcc1Q9D4H2 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
Gcc1Q9D4H2 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Gcc1Q9D4H2 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC27■■□□□ 1.91
Gcc1Q9D4H2 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Gcc1Q9D4H2 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Gcc1Q9D4H2 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Gcc1Q9D4H2 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Gcc1Q9D4H2 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Gcc1Q9D4H2 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Gcc1Q9D4H2 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Gcc1Q9D4H2 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Gcc1Q9D4H2 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Gcc1Q9D4H2 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Gcc1Q9D4H2 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Gcc1Q9D4H2 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Gcc1Q9D4H2 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Gcc1Q9D4H2 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Gcc1Q9D4H2 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Gcc1Q9D4H2 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Gcc1Q9D4H2 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Gcc1Q9D4H2 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Gcc1Q9D4H2 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
Gcc1Q9D4H2 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Gcc1Q9D4H2 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Gcc1Q9D4H2 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Gcc1Q9D4H2 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Gcc1Q9D4H2 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Gcc1Q9D4H2 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
Gcc1Q9D4H2 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
Gcc1Q9D4H2 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.1 ms