Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4E6

Pabpc6, Polyadenylate-binding protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 643 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pabpc6Q9D4E6 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Pabpc6Q9D4E6 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Pabpc6Q9D4E6 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Pabpc6Q9D4E6 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Pabpc6Q9D4E6 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Pabpc6Q9D4E6 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Pabpc6Q9D4E6 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Pabpc6Q9D4E6 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Pabpc6Q9D4E6 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Pabpc6Q9D4E6 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Pabpc6Q9D4E6 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Pabpc6Q9D4E6 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Pabpc6Q9D4E6 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Pabpc6Q9D4E6 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Pabpc6Q9D4E6 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
Pabpc6Q9D4E6 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Pabpc6Q9D4E6 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Pabpc6Q9D4E6 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Pabpc6Q9D4E6 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Pabpc6Q9D4E6 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Pabpc6Q9D4E6 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Pabpc6Q9D4E6 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Pabpc6Q9D4E6 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Pabpc6Q9D4E6 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Pabpc6Q9D4E6 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Pabpc6Q9D4E6 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Pabpc6Q9D4E6 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Pabpc6Q9D4E6 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Pabpc6Q9D4E6 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Pabpc6Q9D4E6 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Pabpc6Q9D4E6 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Pabpc6Q9D4E6 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Pabpc6Q9D4E6 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Pabpc6Q9D4E6 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Pabpc6Q9D4E6 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Pabpc6Q9D4E6 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Pabpc6Q9D4E6 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Pabpc6Q9D4E6 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Pabpc6Q9D4E6 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Pabpc6Q9D4E6 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Pabpc6Q9D4E6 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
Pabpc6Q9D4E6 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Pabpc6Q9D4E6 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Pabpc6Q9D4E6 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Pabpc6Q9D4E6 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Pabpc6Q9D4E6 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Pabpc6Q9D4E6 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Pabpc6Q9D4E6 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Pabpc6Q9D4E6 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Pabpc6Q9D4E6 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Pabpc6Q9D4E6 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Pabpc6Q9D4E6 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Pabpc6Q9D4E6 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Pabpc6Q9D4E6 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Pabpc6Q9D4E6 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Pabpc6Q9D4E6 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Pabpc6Q9D4E6 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Pabpc6Q9D4E6 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Pabpc6Q9D4E6 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Pabpc6Q9D4E6 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Pabpc6Q9D4E6 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Pabpc6Q9D4E6 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Pabpc6Q9D4E6 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Pabpc6Q9D4E6 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Pabpc6Q9D4E6 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Pabpc6Q9D4E6 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Pabpc6Q9D4E6 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Pabpc6Q9D4E6 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Pabpc6Q9D4E6 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Pabpc6Q9D4E6 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Pabpc6Q9D4E6 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Pabpc6Q9D4E6 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Pabpc6Q9D4E6 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Pabpc6Q9D4E6 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Pabpc6Q9D4E6 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Pabpc6Q9D4E6 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Pabpc6Q9D4E6 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Pabpc6Q9D4E6 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Pabpc6Q9D4E6 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Pabpc6Q9D4E6 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Pabpc6Q9D4E6 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Pabpc6Q9D4E6 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Pabpc6Q9D4E6 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Pabpc6Q9D4E6 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Pabpc6Q9D4E6 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Pabpc6Q9D4E6 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Pabpc6Q9D4E6 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Pabpc6Q9D4E6 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
Pabpc6Q9D4E6 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
Pabpc6Q9D4E6 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Pabpc6Q9D4E6 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Pabpc6Q9D4E6 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Pabpc6Q9D4E6 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Pabpc6Q9D4E6 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Pabpc6Q9D4E6 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Pabpc6Q9D4E6 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Pabpc6Q9D4E6 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
Pabpc6Q9D4E6 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Pabpc6Q9D4E6 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Pabpc6Q9D4E6 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms