Protein–RNA interactions for Protein: Q9D485

Efhc2, EF-hand domain-containing family member C2, mousemouse

Predictions only

Length 750 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Efhc2Q9D485 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Efhc2Q9D485 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Efhc2Q9D485 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Efhc2Q9D485 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Efhc2Q9D485 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Efhc2Q9D485 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Efhc2Q9D485 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Efhc2Q9D485 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Efhc2Q9D485 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Efhc2Q9D485 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Efhc2Q9D485 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Efhc2Q9D485 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Efhc2Q9D485 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Efhc2Q9D485 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Efhc2Q9D485 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Efhc2Q9D485 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Efhc2Q9D485 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Efhc2Q9D485 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Efhc2Q9D485 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Efhc2Q9D485 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Efhc2Q9D485 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Efhc2Q9D485 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Efhc2Q9D485 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Efhc2Q9D485 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Efhc2Q9D485 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Efhc2Q9D485 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Efhc2Q9D485 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Efhc2Q9D485 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Efhc2Q9D485 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Efhc2Q9D485 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Efhc2Q9D485 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Efhc2Q9D485 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Efhc2Q9D485 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Efhc2Q9D485 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Efhc2Q9D485 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Efhc2Q9D485 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Efhc2Q9D485 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Efhc2Q9D485 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Efhc2Q9D485 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Efhc2Q9D485 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Efhc2Q9D485 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Efhc2Q9D485 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Efhc2Q9D485 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Efhc2Q9D485 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Efhc2Q9D485 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Efhc2Q9D485 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Efhc2Q9D485 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Efhc2Q9D485 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Efhc2Q9D485 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Efhc2Q9D485 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Efhc2Q9D485 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Efhc2Q9D485 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Efhc2Q9D485 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Efhc2Q9D485 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Efhc2Q9D485 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Efhc2Q9D485 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Efhc2Q9D485 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Efhc2Q9D485 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Efhc2Q9D485 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Efhc2Q9D485 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Efhc2Q9D485 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Efhc2Q9D485 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Efhc2Q9D485 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Efhc2Q9D485 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Efhc2Q9D485 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Efhc2Q9D485 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Efhc2Q9D485 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Efhc2Q9D485 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Efhc2Q9D485 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Efhc2Q9D485 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Efhc2Q9D485 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Efhc2Q9D485 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Efhc2Q9D485 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Efhc2Q9D485 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Efhc2Q9D485 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Efhc2Q9D485 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Efhc2Q9D485 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Efhc2Q9D485 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Efhc2Q9D485 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Efhc2Q9D485 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Efhc2Q9D485 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Efhc2Q9D485 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Efhc2Q9D485 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Efhc2Q9D485 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Efhc2Q9D485 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Efhc2Q9D485 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Efhc2Q9D485 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Efhc2Q9D485 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Efhc2Q9D485 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Efhc2Q9D485 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Efhc2Q9D485 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Efhc2Q9D485 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Efhc2Q9D485 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Efhc2Q9D485 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Efhc2Q9D485 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Efhc2Q9D485 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Efhc2Q9D485 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Efhc2Q9D485 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Efhc2Q9D485 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Efhc2Q9D485 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.8 ms