Protein–RNA interactions for Protein: Q9D103

Ifitm1, Interferon-induced transmembrane protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 106 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifitm1Q9D103 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ifitm1Q9D103 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ifitm1Q9D103 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ifitm1Q9D103 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ifitm1Q9D103 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ifitm1Q9D103 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ifitm1Q9D103 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ifitm1Q9D103 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ifitm1Q9D103 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ifitm1Q9D103 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ifitm1Q9D103 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ifitm1Q9D103 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ifitm1Q9D103 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ifitm1Q9D103 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ifitm1Q9D103 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ifitm1Q9D103 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Ifitm1Q9D103 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ifitm1Q9D103 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ifitm1Q9D103 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ifitm1Q9D103 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ifitm1Q9D103 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ifitm1Q9D103 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ifitm1Q9D103 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ifitm1Q9D103 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ifitm1Q9D103 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ifitm1Q9D103 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ifitm1Q9D103 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ifitm1Q9D103 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ifitm1Q9D103 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ifitm1Q9D103 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ifitm1Q9D103 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ifitm1Q9D103 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ifitm1Q9D103 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ifitm1Q9D103 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ifitm1Q9D103 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ifitm1Q9D103 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ifitm1Q9D103 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ifitm1Q9D103 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ifitm1Q9D103 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ifitm1Q9D103 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ifitm1Q9D103 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Ifitm1Q9D103 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ifitm1Q9D103 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ifitm1Q9D103 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ifitm1Q9D103 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ifitm1Q9D103 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ifitm1Q9D103 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ifitm1Q9D103 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ifitm1Q9D103 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ifitm1Q9D103 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ifitm1Q9D103 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ifitm1Q9D103 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ifitm1Q9D103 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ifitm1Q9D103 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ifitm1Q9D103 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ifitm1Q9D103 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ifitm1Q9D103 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ifitm1Q9D103 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ifitm1Q9D103 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ifitm1Q9D103 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ifitm1Q9D103 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ifitm1Q9D103 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ifitm1Q9D103 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ifitm1Q9D103 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Ifitm1Q9D103 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ifitm1Q9D103 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ifitm1Q9D103 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ifitm1Q9D103 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ifitm1Q9D103 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ifitm1Q9D103 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ifitm1Q9D103 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ifitm1Q9D103 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ifitm1Q9D103 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ifitm1Q9D103 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Ifitm1Q9D103 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ifitm1Q9D103 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ifitm1Q9D103 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ifitm1Q9D103 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ifitm1Q9D103 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ifitm1Q9D103 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ifitm1Q9D103 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ifitm1Q9D103 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ifitm1Q9D103 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ifitm1Q9D103 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Ifitm1Q9D103 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ifitm1Q9D103 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ifitm1Q9D103 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ifitm1Q9D103 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ifitm1Q9D103 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ifitm1Q9D103 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ifitm1Q9D103 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ifitm1Q9D103 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ifitm1Q9D103 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ifitm1Q9D103 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ifitm1Q9D103 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ifitm1Q9D103 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ifitm1Q9D103 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ifitm1Q9D103 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ifitm1Q9D103 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ifitm1Q9D103 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35 ms