Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZB3

Thumpd2, THUMP domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 528 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Thumpd2Q9CZB3 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Thumpd2Q9CZB3 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Thumpd2Q9CZB3 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Thumpd2Q9CZB3 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Thumpd2Q9CZB3 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Thumpd2Q9CZB3 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Thumpd2Q9CZB3 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Thumpd2Q9CZB3 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Thumpd2Q9CZB3 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Thumpd2Q9CZB3 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Thumpd2Q9CZB3 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Thumpd2Q9CZB3 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Thumpd2Q9CZB3 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Thumpd2Q9CZB3 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Thumpd2Q9CZB3 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Thumpd2Q9CZB3 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Thumpd2Q9CZB3 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Thumpd2Q9CZB3 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Thumpd2Q9CZB3 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Thumpd2Q9CZB3 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Thumpd2Q9CZB3 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Thumpd2Q9CZB3 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Thumpd2Q9CZB3 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Thumpd2Q9CZB3 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Thumpd2Q9CZB3 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Thumpd2Q9CZB3 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Thumpd2Q9CZB3 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Thumpd2Q9CZB3 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Thumpd2Q9CZB3 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Thumpd2Q9CZB3 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Thumpd2Q9CZB3 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Thumpd2Q9CZB3 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Thumpd2Q9CZB3 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Thumpd2Q9CZB3 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Thumpd2Q9CZB3 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Thumpd2Q9CZB3 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Thumpd2Q9CZB3 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Thumpd2Q9CZB3 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Thumpd2Q9CZB3 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Thumpd2Q9CZB3 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Thumpd2Q9CZB3 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Thumpd2Q9CZB3 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Thumpd2Q9CZB3 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Thumpd2Q9CZB3 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Thumpd2Q9CZB3 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Thumpd2Q9CZB3 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Thumpd2Q9CZB3 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Thumpd2Q9CZB3 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Thumpd2Q9CZB3 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Thumpd2Q9CZB3 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Thumpd2Q9CZB3 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Thumpd2Q9CZB3 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Thumpd2Q9CZB3 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Thumpd2Q9CZB3 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Thumpd2Q9CZB3 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Thumpd2Q9CZB3 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Thumpd2Q9CZB3 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Thumpd2Q9CZB3 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Thumpd2Q9CZB3 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Thumpd2Q9CZB3 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Thumpd2Q9CZB3 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Thumpd2Q9CZB3 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Thumpd2Q9CZB3 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Thumpd2Q9CZB3 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Thumpd2Q9CZB3 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Thumpd2Q9CZB3 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Thumpd2Q9CZB3 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Thumpd2Q9CZB3 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Thumpd2Q9CZB3 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Thumpd2Q9CZB3 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Thumpd2Q9CZB3 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Thumpd2Q9CZB3 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Thumpd2Q9CZB3 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Thumpd2Q9CZB3 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Thumpd2Q9CZB3 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Thumpd2Q9CZB3 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Thumpd2Q9CZB3 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Thumpd2Q9CZB3 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Thumpd2Q9CZB3 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Thumpd2Q9CZB3 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Thumpd2Q9CZB3 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Thumpd2Q9CZB3 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Thumpd2Q9CZB3 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Thumpd2Q9CZB3 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Thumpd2Q9CZB3 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Thumpd2Q9CZB3 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Thumpd2Q9CZB3 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Thumpd2Q9CZB3 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Thumpd2Q9CZB3 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Thumpd2Q9CZB3 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Thumpd2Q9CZB3 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.27
Thumpd2Q9CZB3 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Thumpd2Q9CZB3 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Thumpd2Q9CZB3 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Thumpd2Q9CZB3 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Thumpd2Q9CZB3 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Thumpd2Q9CZB3 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Thumpd2Q9CZB3 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Thumpd2Q9CZB3 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Thumpd2Q9CZB3 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.3 ms