Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXH7

Sgo1, Shugoshin 1, mousemouse

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Length 517 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sgo1Q9CXH7 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Sgo1Q9CXH7 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Sgo1Q9CXH7 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Sgo1Q9CXH7 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Sgo1Q9CXH7 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
Sgo1Q9CXH7 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Sgo1Q9CXH7 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
Sgo1Q9CXH7 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Sgo1Q9CXH7 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Sgo1Q9CXH7 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Sgo1Q9CXH7 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Sgo1Q9CXH7 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Sgo1Q9CXH7 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Sgo1Q9CXH7 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Sgo1Q9CXH7 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Sgo1Q9CXH7 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Sgo1Q9CXH7 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Sgo1Q9CXH7 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Sgo1Q9CXH7 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Sgo1Q9CXH7 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Sgo1Q9CXH7 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Sgo1Q9CXH7 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Sgo1Q9CXH7 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Sgo1Q9CXH7 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Sgo1Q9CXH7 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Sgo1Q9CXH7 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Sgo1Q9CXH7 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Sgo1Q9CXH7 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Sgo1Q9CXH7 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Sgo1Q9CXH7 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Sgo1Q9CXH7 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Sgo1Q9CXH7 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Sgo1Q9CXH7 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Sgo1Q9CXH7 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Sgo1Q9CXH7 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Sgo1Q9CXH7 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Sgo1Q9CXH7 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Sgo1Q9CXH7 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Sgo1Q9CXH7 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Sgo1Q9CXH7 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Sgo1Q9CXH7 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Sgo1Q9CXH7 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Sgo1Q9CXH7 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Sgo1Q9CXH7 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Sgo1Q9CXH7 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Sgo1Q9CXH7 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Sgo1Q9CXH7 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Sgo1Q9CXH7 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Sgo1Q9CXH7 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Sgo1Q9CXH7 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Sgo1Q9CXH7 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Sgo1Q9CXH7 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Sgo1Q9CXH7 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Sgo1Q9CXH7 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Sgo1Q9CXH7 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Sgo1Q9CXH7 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Sgo1Q9CXH7 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Sgo1Q9CXH7 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Sgo1Q9CXH7 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Sgo1Q9CXH7 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Sgo1Q9CXH7 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Sgo1Q9CXH7 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Sgo1Q9CXH7 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Sgo1Q9CXH7 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Sgo1Q9CXH7 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Sgo1Q9CXH7 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Sgo1Q9CXH7 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Sgo1Q9CXH7 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Sgo1Q9CXH7 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Sgo1Q9CXH7 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Sgo1Q9CXH7 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Sgo1Q9CXH7 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Sgo1Q9CXH7 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Sgo1Q9CXH7 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Sgo1Q9CXH7 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Sgo1Q9CXH7 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Sgo1Q9CXH7 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Sgo1Q9CXH7 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Sgo1Q9CXH7 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
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Sgo1Q9CXH7 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Sgo1Q9CXH7 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Sgo1Q9CXH7 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Sgo1Q9CXH7 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Sgo1Q9CXH7 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Sgo1Q9CXH7 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Sgo1Q9CXH7 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Sgo1Q9CXH7 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Sgo1Q9CXH7 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Sgo1Q9CXH7 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Sgo1Q9CXH7 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Sgo1Q9CXH7 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Sgo1Q9CXH7 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Sgo1Q9CXH7 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Sgo1Q9CXH7 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Sgo1Q9CXH7 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Sgo1Q9CXH7 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Sgo1Q9CXH7 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Sgo1Q9CXH7 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Sgo1Q9CXH7 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 138.5 ms