Protein–RNA interactions for Protein: Q9CW03

Smc3, Structural maintenance of chromosomes protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smc3Q9CW03 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Smc3Q9CW03 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
Smc3Q9CW03 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Smc3Q9CW03 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Smc3Q9CW03 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Smc3Q9CW03 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Smc3Q9CW03 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Smc3Q9CW03 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Smc3Q9CW03 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
Smc3Q9CW03 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Smc3Q9CW03 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Smc3Q9CW03 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
Smc3Q9CW03 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Smc3Q9CW03 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Smc3Q9CW03 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Smc3Q9CW03 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Smc3Q9CW03 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Smc3Q9CW03 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Smc3Q9CW03 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Smc3Q9CW03 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Smc3Q9CW03 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Smc3Q9CW03 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
Smc3Q9CW03 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Smc3Q9CW03 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Smc3Q9CW03 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Smc3Q9CW03 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Smc3Q9CW03 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Smc3Q9CW03 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Smc3Q9CW03 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
Smc3Q9CW03 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Smc3Q9CW03 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Smc3Q9CW03 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Smc3Q9CW03 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Smc3Q9CW03 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Smc3Q9CW03 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Smc3Q9CW03 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Smc3Q9CW03 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
Smc3Q9CW03 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Smc3Q9CW03 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Smc3Q9CW03 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Smc3Q9CW03 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Smc3Q9CW03 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Smc3Q9CW03 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
Smc3Q9CW03 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Smc3Q9CW03 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Smc3Q9CW03 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Smc3Q9CW03 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Smc3Q9CW03 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Smc3Q9CW03 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Smc3Q9CW03 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Smc3Q9CW03 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Smc3Q9CW03 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
Smc3Q9CW03 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Smc3Q9CW03 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Smc3Q9CW03 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Smc3Q9CW03 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Smc3Q9CW03 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Smc3Q9CW03 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Smc3Q9CW03 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Smc3Q9CW03 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Smc3Q9CW03 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Smc3Q9CW03 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Smc3Q9CW03 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Smc3Q9CW03 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
Smc3Q9CW03 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Smc3Q9CW03 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Smc3Q9CW03 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Smc3Q9CW03 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Smc3Q9CW03 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Smc3Q9CW03 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Smc3Q9CW03 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Smc3Q9CW03 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Smc3Q9CW03 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Smc3Q9CW03 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Smc3Q9CW03 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Smc3Q9CW03 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Smc3Q9CW03 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Smc3Q9CW03 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Smc3Q9CW03 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Smc3Q9CW03 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Smc3Q9CW03 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Smc3Q9CW03 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Smc3Q9CW03 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Smc3Q9CW03 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Smc3Q9CW03 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Smc3Q9CW03 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Smc3Q9CW03 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Smc3Q9CW03 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Smc3Q9CW03 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Smc3Q9CW03 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Smc3Q9CW03 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Smc3Q9CW03 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Smc3Q9CW03 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Smc3Q9CW03 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Smc3Q9CW03 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
Smc3Q9CW03 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Smc3Q9CW03 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Smc3Q9CW03 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Smc3Q9CW03 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Smc3Q9CW03 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.9 ms