Protein–RNA interactions for Protein: Q9CTG6

Atp13a2, Cation-transporting ATPase 13A2, mousemouse

Predictions only

Length 1,169 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp13a2Q9CTG6 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Atp13a2Q9CTG6 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Atp13a2Q9CTG6 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Atp13a2Q9CTG6 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Atp13a2Q9CTG6 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Atp13a2Q9CTG6 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Atp13a2Q9CTG6 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Atp13a2Q9CTG6 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Atp13a2Q9CTG6 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Atp13a2Q9CTG6 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Atp13a2Q9CTG6 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Atp13a2Q9CTG6 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Atp13a2Q9CTG6 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Atp13a2Q9CTG6 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Atp13a2Q9CTG6 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Atp13a2Q9CTG6 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Atp13a2Q9CTG6 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Atp13a2Q9CTG6 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Atp13a2Q9CTG6 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Atp13a2Q9CTG6 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Atp13a2Q9CTG6 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Atp13a2Q9CTG6 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Atp13a2Q9CTG6 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Atp13a2Q9CTG6 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Atp13a2Q9CTG6 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Atp13a2Q9CTG6 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Atp13a2Q9CTG6 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Atp13a2Q9CTG6 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Atp13a2Q9CTG6 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Atp13a2Q9CTG6 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
Atp13a2Q9CTG6 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Atp13a2Q9CTG6 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
Atp13a2Q9CTG6 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Atp13a2Q9CTG6 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Atp13a2Q9CTG6 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Atp13a2Q9CTG6 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Atp13a2Q9CTG6 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Atp13a2Q9CTG6 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Atp13a2Q9CTG6 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Atp13a2Q9CTG6 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Atp13a2Q9CTG6 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Atp13a2Q9CTG6 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Atp13a2Q9CTG6 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Atp13a2Q9CTG6 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Atp13a2Q9CTG6 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
Atp13a2Q9CTG6 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Atp13a2Q9CTG6 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Atp13a2Q9CTG6 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
Atp13a2Q9CTG6 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Atp13a2Q9CTG6 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Atp13a2Q9CTG6 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Atp13a2Q9CTG6 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Atp13a2Q9CTG6 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Atp13a2Q9CTG6 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Atp13a2Q9CTG6 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Atp13a2Q9CTG6 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Atp13a2Q9CTG6 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Atp13a2Q9CTG6 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Atp13a2Q9CTG6 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Atp13a2Q9CTG6 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Atp13a2Q9CTG6 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Atp13a2Q9CTG6 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Atp13a2Q9CTG6 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Atp13a2Q9CTG6 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Atp13a2Q9CTG6 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Atp13a2Q9CTG6 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Atp13a2Q9CTG6 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Atp13a2Q9CTG6 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Atp13a2Q9CTG6 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Atp13a2Q9CTG6 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Atp13a2Q9CTG6 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Atp13a2Q9CTG6 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Atp13a2Q9CTG6 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Atp13a2Q9CTG6 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Atp13a2Q9CTG6 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Atp13a2Q9CTG6 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Atp13a2Q9CTG6 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Atp13a2Q9CTG6 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Atp13a2Q9CTG6 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Atp13a2Q9CTG6 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Atp13a2Q9CTG6 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Atp13a2Q9CTG6 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Atp13a2Q9CTG6 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Atp13a2Q9CTG6 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Atp13a2Q9CTG6 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Atp13a2Q9CTG6 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Atp13a2Q9CTG6 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Atp13a2Q9CTG6 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Atp13a2Q9CTG6 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Atp13a2Q9CTG6 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Atp13a2Q9CTG6 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Atp13a2Q9CTG6 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Atp13a2Q9CTG6 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Atp13a2Q9CTG6 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Atp13a2Q9CTG6 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Atp13a2Q9CTG6 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Atp13a2Q9CTG6 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Atp13a2Q9CTG6 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Atp13a2Q9CTG6 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Atp13a2Q9CTG6 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.9 ms