Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQZ7

Polr3k, DNA-directed RNA polymerase III subunit RPC10, mousemouse

Predictions only

Length 108 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr3kQ9CQZ7 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Polr3kQ9CQZ7 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Polr3kQ9CQZ7 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Polr3kQ9CQZ7 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Polr3kQ9CQZ7 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Polr3kQ9CQZ7 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Polr3kQ9CQZ7 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Polr3kQ9CQZ7 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Polr3kQ9CQZ7 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Polr3kQ9CQZ7 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Polr3kQ9CQZ7 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Polr3kQ9CQZ7 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Polr3kQ9CQZ7 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Polr3kQ9CQZ7 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Polr3kQ9CQZ7 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Polr3kQ9CQZ7 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Polr3kQ9CQZ7 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Polr3kQ9CQZ7 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Polr3kQ9CQZ7 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Polr3kQ9CQZ7 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Polr3kQ9CQZ7 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Polr3kQ9CQZ7 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Polr3kQ9CQZ7 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Polr3kQ9CQZ7 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Polr3kQ9CQZ7 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Polr3kQ9CQZ7 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Polr3kQ9CQZ7 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Polr3kQ9CQZ7 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Polr3kQ9CQZ7 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Polr3kQ9CQZ7 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Polr3kQ9CQZ7 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Polr3kQ9CQZ7 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Polr3kQ9CQZ7 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Polr3kQ9CQZ7 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Polr3kQ9CQZ7 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Polr3kQ9CQZ7 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Polr3kQ9CQZ7 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Polr3kQ9CQZ7 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Polr3kQ9CQZ7 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Polr3kQ9CQZ7 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Polr3kQ9CQZ7 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Polr3kQ9CQZ7 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Polr3kQ9CQZ7 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Polr3kQ9CQZ7 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Polr3kQ9CQZ7 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Polr3kQ9CQZ7 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Polr3kQ9CQZ7 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Polr3kQ9CQZ7 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Polr3kQ9CQZ7 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Polr3kQ9CQZ7 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Polr3kQ9CQZ7 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Polr3kQ9CQZ7 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Polr3kQ9CQZ7 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Polr3kQ9CQZ7 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Polr3kQ9CQZ7 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Polr3kQ9CQZ7 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Polr3kQ9CQZ7 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Polr3kQ9CQZ7 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Polr3kQ9CQZ7 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Polr3kQ9CQZ7 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Polr3kQ9CQZ7 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Polr3kQ9CQZ7 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Polr3kQ9CQZ7 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Polr3kQ9CQZ7 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Polr3kQ9CQZ7 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Polr3kQ9CQZ7 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Polr3kQ9CQZ7 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Polr3kQ9CQZ7 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Polr3kQ9CQZ7 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Polr3kQ9CQZ7 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Polr3kQ9CQZ7 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Polr3kQ9CQZ7 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Polr3kQ9CQZ7 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Polr3kQ9CQZ7 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Polr3kQ9CQZ7 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Polr3kQ9CQZ7 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Polr3kQ9CQZ7 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Polr3kQ9CQZ7 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Polr3kQ9CQZ7 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Polr3kQ9CQZ7 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Polr3kQ9CQZ7 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Polr3kQ9CQZ7 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Polr3kQ9CQZ7 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Polr3kQ9CQZ7 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Polr3kQ9CQZ7 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Polr3kQ9CQZ7 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Polr3kQ9CQZ7 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Polr3kQ9CQZ7 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Polr3kQ9CQZ7 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Polr3kQ9CQZ7 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Polr3kQ9CQZ7 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Polr3kQ9CQZ7 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Polr3kQ9CQZ7 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Polr3kQ9CQZ7 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Polr3kQ9CQZ7 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Polr3kQ9CQZ7 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Polr3kQ9CQZ7 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Polr3kQ9CQZ7 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Polr3kQ9CQZ7 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Polr3kQ9CQZ7 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.2 ms