Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQM1

Type III endosome membrane protein TEMP, mousemouse

Predictions only

Length 111 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9CQM1 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Q9CQM1 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Q9CQM1 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Q9CQM1 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Q9CQM1 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Q9CQM1 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Q9CQM1 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Q9CQM1 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Q9CQM1 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Q9CQM1 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Q9CQM1 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Q9CQM1 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Q9CQM1 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Q9CQM1 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Q9CQM1 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Q9CQM1 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Q9CQM1 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Q9CQM1 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Q9CQM1 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Q9CQM1 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Q9CQM1 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Q9CQM1 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Q9CQM1 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Q9CQM1 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Q9CQM1 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Q9CQM1 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Q9CQM1 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Q9CQM1 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Q9CQM1 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Q9CQM1 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Q9CQM1 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Q9CQM1 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Q9CQM1 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Q9CQM1 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Q9CQM1 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Q9CQM1 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Q9CQM1 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Q9CQM1 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Q9CQM1 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Q9CQM1 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Q9CQM1 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Q9CQM1 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Q9CQM1 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Q9CQM1 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Q9CQM1 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Q9CQM1 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Q9CQM1 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Q9CQM1 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Q9CQM1 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Q9CQM1 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Q9CQM1 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Q9CQM1 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Q9CQM1 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Q9CQM1 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Q9CQM1 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Q9CQM1 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Q9CQM1 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Q9CQM1 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Q9CQM1 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Q9CQM1 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Q9CQM1 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Q9CQM1 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Q9CQM1 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
Q9CQM1 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Q9CQM1 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Q9CQM1 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Q9CQM1 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Q9CQM1 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Q9CQM1 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Q9CQM1 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Q9CQM1 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Q9CQM1 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Q9CQM1 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Q9CQM1 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Q9CQM1 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Q9CQM1 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Q9CQM1 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Q9CQM1 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Q9CQM1 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Q9CQM1 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Q9CQM1 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Q9CQM1 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Q9CQM1 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Q9CQM1 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Q9CQM1 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Q9CQM1 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Q9CQM1 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Q9CQM1 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Q9CQM1 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Q9CQM1 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Q9CQM1 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Q9CQM1 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Q9CQM1 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Q9CQM1 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Q9CQM1 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Q9CQM1 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Q9CQM1 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Q9CQM1 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Q9CQM1 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Q9CQM1 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms