Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQA5

Med4, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 4, mousemouse

Predictions only

Length 270 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Med4Q9CQA5 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Med4Q9CQA5 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
Med4Q9CQA5 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Med4Q9CQA5 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
Med4Q9CQA5 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Med4Q9CQA5 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Med4Q9CQA5 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Med4Q9CQA5 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Med4Q9CQA5 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Med4Q9CQA5 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Med4Q9CQA5 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Med4Q9CQA5 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Med4Q9CQA5 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Med4Q9CQA5 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Med4Q9CQA5 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Med4Q9CQA5 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Med4Q9CQA5 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Med4Q9CQA5 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Med4Q9CQA5 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Med4Q9CQA5 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Med4Q9CQA5 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Med4Q9CQA5 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Med4Q9CQA5 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Med4Q9CQA5 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Med4Q9CQA5 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Med4Q9CQA5 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Med4Q9CQA5 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Med4Q9CQA5 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Med4Q9CQA5 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Med4Q9CQA5 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Med4Q9CQA5 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Med4Q9CQA5 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Med4Q9CQA5 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Med4Q9CQA5 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Med4Q9CQA5 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Med4Q9CQA5 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Med4Q9CQA5 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Med4Q9CQA5 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Med4Q9CQA5 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Med4Q9CQA5 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Med4Q9CQA5 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Med4Q9CQA5 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Med4Q9CQA5 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Med4Q9CQA5 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Med4Q9CQA5 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Med4Q9CQA5 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Med4Q9CQA5 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Med4Q9CQA5 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Med4Q9CQA5 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Med4Q9CQA5 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Med4Q9CQA5 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Med4Q9CQA5 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Med4Q9CQA5 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Med4Q9CQA5 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Med4Q9CQA5 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Med4Q9CQA5 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Med4Q9CQA5 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Med4Q9CQA5 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
Med4Q9CQA5 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
Med4Q9CQA5 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
Med4Q9CQA5 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Med4Q9CQA5 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Med4Q9CQA5 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Med4Q9CQA5 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Med4Q9CQA5 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Med4Q9CQA5 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Med4Q9CQA5 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Med4Q9CQA5 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Med4Q9CQA5 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Med4Q9CQA5 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Med4Q9CQA5 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Med4Q9CQA5 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Med4Q9CQA5 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Med4Q9CQA5 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC25.14■■□□□ 1.61
Med4Q9CQA5 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Med4Q9CQA5 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Med4Q9CQA5 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Med4Q9CQA5 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Med4Q9CQA5 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Med4Q9CQA5 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Med4Q9CQA5 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Med4Q9CQA5 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Med4Q9CQA5 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Med4Q9CQA5 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Med4Q9CQA5 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Med4Q9CQA5 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Med4Q9CQA5 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
Med4Q9CQA5 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Med4Q9CQA5 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Med4Q9CQA5 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Med4Q9CQA5 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Med4Q9CQA5 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Med4Q9CQA5 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Med4Q9CQA5 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Med4Q9CQA5 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Med4Q9CQA5 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Med4Q9CQA5 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Med4Q9CQA5 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Med4Q9CQA5 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Med4Q9CQA5 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.5 ms