Protein–RNA interactions for Protein: Q99NH8

Trem2, Triggering receptor expressed on myeloid cells 2, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trem2Q99NH8 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Trem2Q99NH8 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Trem2Q99NH8 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Trem2Q99NH8 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Trem2Q99NH8 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Trem2Q99NH8 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Trem2Q99NH8 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Trem2Q99NH8 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Trem2Q99NH8 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Trem2Q99NH8 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Trem2Q99NH8 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Trem2Q99NH8 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Trem2Q99NH8 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Trem2Q99NH8 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Trem2Q99NH8 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Trem2Q99NH8 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Trem2Q99NH8 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Trem2Q99NH8 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Trem2Q99NH8 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Trem2Q99NH8 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Trem2Q99NH8 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Trem2Q99NH8 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Trem2Q99NH8 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Trem2Q99NH8 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Trem2Q99NH8 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Trem2Q99NH8 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Trem2Q99NH8 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Trem2Q99NH8 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Trem2Q99NH8 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Trem2Q99NH8 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Trem2Q99NH8 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Trem2Q99NH8 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Trem2Q99NH8 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Trem2Q99NH8 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Trem2Q99NH8 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Trem2Q99NH8 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Trem2Q99NH8 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Trem2Q99NH8 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Trem2Q99NH8 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Trem2Q99NH8 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Trem2Q99NH8 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Trem2Q99NH8 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Trem2Q99NH8 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Trem2Q99NH8 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Trem2Q99NH8 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Trem2Q99NH8 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Trem2Q99NH8 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Trem2Q99NH8 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Trem2Q99NH8 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Trem2Q99NH8 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Trem2Q99NH8 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Trem2Q99NH8 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Trem2Q99NH8 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Trem2Q99NH8 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Trem2Q99NH8 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Trem2Q99NH8 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Trem2Q99NH8 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Trem2Q99NH8 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Trem2Q99NH8 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Trem2Q99NH8 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Trem2Q99NH8 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Trem2Q99NH8 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Trem2Q99NH8 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Trem2Q99NH8 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Trem2Q99NH8 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Trem2Q99NH8 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Trem2Q99NH8 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Trem2Q99NH8 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Trem2Q99NH8 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Trem2Q99NH8 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Trem2Q99NH8 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
Trem2Q99NH8 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
Trem2Q99NH8 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Trem2Q99NH8 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Trem2Q99NH8 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Trem2Q99NH8 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Trem2Q99NH8 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Trem2Q99NH8 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Trem2Q99NH8 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Trem2Q99NH8 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Trem2Q99NH8 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Trem2Q99NH8 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Trem2Q99NH8 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Trem2Q99NH8 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Trem2Q99NH8 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Trem2Q99NH8 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Trem2Q99NH8 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Trem2Q99NH8 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Trem2Q99NH8 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Trem2Q99NH8 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Trem2Q99NH8 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Trem2Q99NH8 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Trem2Q99NH8 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Trem2Q99NH8 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Trem2Q99NH8 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Trem2Q99NH8 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Trem2Q99NH8 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Trem2Q99NH8 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Trem2Q99NH8 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Trem2Q99NH8 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.2 ms