Protein–RNA interactions for Protein: Q99N95

Mrpl3, 39S ribosomal protein L3, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 348 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl3Q99N95 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Mrpl3Q99N95 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Mrpl3Q99N95 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Mrpl3Q99N95 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Mrpl3Q99N95 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Mrpl3Q99N95 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Mrpl3Q99N95 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Mrpl3Q99N95 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Mrpl3Q99N95 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Mrpl3Q99N95 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Mrpl3Q99N95 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Mrpl3Q99N95 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Mrpl3Q99N95 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Mrpl3Q99N95 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Mrpl3Q99N95 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Mrpl3Q99N95 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Mrpl3Q99N95 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Mrpl3Q99N95 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Mrpl3Q99N95 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Mrpl3Q99N95 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Mrpl3Q99N95 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Mrpl3Q99N95 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Mrpl3Q99N95 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Mrpl3Q99N95 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Mrpl3Q99N95 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Mrpl3Q99N95 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Mrpl3Q99N95 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Mrpl3Q99N95 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Mrpl3Q99N95 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Mrpl3Q99N95 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Mrpl3Q99N95 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Mrpl3Q99N95 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Mrpl3Q99N95 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Mrpl3Q99N95 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Mrpl3Q99N95 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Mrpl3Q99N95 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Mrpl3Q99N95 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Mrpl3Q99N95 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Mrpl3Q99N95 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Mrpl3Q99N95 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Mrpl3Q99N95 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Mrpl3Q99N95 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Mrpl3Q99N95 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Mrpl3Q99N95 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Mrpl3Q99N95 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Mrpl3Q99N95 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Mrpl3Q99N95 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Mrpl3Q99N95 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Mrpl3Q99N95 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Mrpl3Q99N95 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Mrpl3Q99N95 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Mrpl3Q99N95 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Mrpl3Q99N95 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Mrpl3Q99N95 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Mrpl3Q99N95 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Mrpl3Q99N95 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Mrpl3Q99N95 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Mrpl3Q99N95 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Mrpl3Q99N95 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Mrpl3Q99N95 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Mrpl3Q99N95 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Mrpl3Q99N95 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Mrpl3Q99N95 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Mrpl3Q99N95 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Mrpl3Q99N95 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Mrpl3Q99N95 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Mrpl3Q99N95 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Mrpl3Q99N95 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Mrpl3Q99N95 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Mrpl3Q99N95 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Mrpl3Q99N95 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Mrpl3Q99N95 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Mrpl3Q99N95 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Mrpl3Q99N95 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Mrpl3Q99N95 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Mrpl3Q99N95 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Mrpl3Q99N95 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Mrpl3Q99N95 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Mrpl3Q99N95 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Mrpl3Q99N95 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Mrpl3Q99N95 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Mrpl3Q99N95 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Mrpl3Q99N95 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Mrpl3Q99N95 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Mrpl3Q99N95 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Mrpl3Q99N95 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Mrpl3Q99N95 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Mrpl3Q99N95 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Mrpl3Q99N95 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Mrpl3Q99N95 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Mrpl3Q99N95 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Mrpl3Q99N95 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Mrpl3Q99N95 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Mrpl3Q99N95 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Mrpl3Q99N95 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Mrpl3Q99N95 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Mrpl3Q99N95 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Mrpl3Q99N95 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Mrpl3Q99N95 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Mrpl3Q99N95 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.9 ms