Protein–RNA interactions for Protein: Q99LJ7

Rcbtb2, RCC1 and BTB domain-containing protein 2, mousemouse

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Length 551 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rcbtb2Q99LJ7 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Rcbtb2Q99LJ7 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Rcbtb2Q99LJ7 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Rcbtb2Q99LJ7 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Rcbtb2Q99LJ7 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Rcbtb2Q99LJ7 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Rcbtb2Q99LJ7 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Rcbtb2Q99LJ7 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Rcbtb2Q99LJ7 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Rcbtb2Q99LJ7 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Rcbtb2Q99LJ7 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Rcbtb2Q99LJ7 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Rcbtb2Q99LJ7 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Rcbtb2Q99LJ7 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Rcbtb2Q99LJ7 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Rcbtb2Q99LJ7 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Rcbtb2Q99LJ7 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Rcbtb2Q99LJ7 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Rcbtb2Q99LJ7 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Rcbtb2Q99LJ7 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Rcbtb2Q99LJ7 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Rcbtb2Q99LJ7 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Rcbtb2Q99LJ7 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Rcbtb2Q99LJ7 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Rcbtb2Q99LJ7 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Rcbtb2Q99LJ7 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Rcbtb2Q99LJ7 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Rcbtb2Q99LJ7 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Rcbtb2Q99LJ7 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Rcbtb2Q99LJ7 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Rcbtb2Q99LJ7 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Rcbtb2Q99LJ7 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Rcbtb2Q99LJ7 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Rcbtb2Q99LJ7 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Rcbtb2Q99LJ7 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Rcbtb2Q99LJ7 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Rcbtb2Q99LJ7 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Rcbtb2Q99LJ7 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Rcbtb2Q99LJ7 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Rcbtb2Q99LJ7 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Rcbtb2Q99LJ7 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Rcbtb2Q99LJ7 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Rcbtb2Q99LJ7 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Rcbtb2Q99LJ7 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Rcbtb2Q99LJ7 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Rcbtb2Q99LJ7 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rcbtb2Q99LJ7 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rcbtb2Q99LJ7 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rcbtb2Q99LJ7 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Rcbtb2Q99LJ7 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rcbtb2Q99LJ7 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Rcbtb2Q99LJ7 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rcbtb2Q99LJ7 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rcbtb2Q99LJ7 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rcbtb2Q99LJ7 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rcbtb2Q99LJ7 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rcbtb2Q99LJ7 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rcbtb2Q99LJ7 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rcbtb2Q99LJ7 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Rcbtb2Q99LJ7 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rcbtb2Q99LJ7 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rcbtb2Q99LJ7 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rcbtb2Q99LJ7 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rcbtb2Q99LJ7 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rcbtb2Q99LJ7 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rcbtb2Q99LJ7 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rcbtb2Q99LJ7 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rcbtb2Q99LJ7 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rcbtb2Q99LJ7 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rcbtb2Q99LJ7 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rcbtb2Q99LJ7 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rcbtb2Q99LJ7 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rcbtb2Q99LJ7 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rcbtb2Q99LJ7 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rcbtb2Q99LJ7 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Rcbtb2Q99LJ7 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rcbtb2Q99LJ7 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rcbtb2Q99LJ7 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rcbtb2Q99LJ7 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rcbtb2Q99LJ7 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rcbtb2Q99LJ7 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Rcbtb2Q99LJ7 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rcbtb2Q99LJ7 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rcbtb2Q99LJ7 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rcbtb2Q99LJ7 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rcbtb2Q99LJ7 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rcbtb2Q99LJ7 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rcbtb2Q99LJ7 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Rcbtb2Q99LJ7 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rcbtb2Q99LJ7 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rcbtb2Q99LJ7 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rcbtb2Q99LJ7 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rcbtb2Q99LJ7 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rcbtb2Q99LJ7 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rcbtb2Q99LJ7 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rcbtb2Q99LJ7 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rcbtb2Q99LJ7 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rcbtb2Q99LJ7 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rcbtb2Q99LJ7 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rcbtb2Q99LJ7 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 96.8 ms