Protein–RNA interactions for Protein: Q99LI2

Clcc1, Chloride channel CLIC-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 539 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clcc1Q99LI2 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Clcc1Q99LI2 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Clcc1Q99LI2 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Clcc1Q99LI2 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Clcc1Q99LI2 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Clcc1Q99LI2 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Clcc1Q99LI2 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Clcc1Q99LI2 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Clcc1Q99LI2 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Clcc1Q99LI2 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Clcc1Q99LI2 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Clcc1Q99LI2 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Clcc1Q99LI2 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Clcc1Q99LI2 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Clcc1Q99LI2 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Clcc1Q99LI2 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Clcc1Q99LI2 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Clcc1Q99LI2 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Clcc1Q99LI2 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Clcc1Q99LI2 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC21.83■■□□□ 1.08
Clcc1Q99LI2 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Clcc1Q99LI2 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Clcc1Q99LI2 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Clcc1Q99LI2 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Clcc1Q99LI2 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Clcc1Q99LI2 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Clcc1Q99LI2 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Clcc1Q99LI2 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Clcc1Q99LI2 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Clcc1Q99LI2 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Clcc1Q99LI2 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Clcc1Q99LI2 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Clcc1Q99LI2 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Clcc1Q99LI2 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Clcc1Q99LI2 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Clcc1Q99LI2 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Clcc1Q99LI2 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Clcc1Q99LI2 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Clcc1Q99LI2 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Clcc1Q99LI2 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Clcc1Q99LI2 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Clcc1Q99LI2 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Clcc1Q99LI2 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Clcc1Q99LI2 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Clcc1Q99LI2 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Clcc1Q99LI2 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Clcc1Q99LI2 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Clcc1Q99LI2 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Clcc1Q99LI2 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Clcc1Q99LI2 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Clcc1Q99LI2 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Clcc1Q99LI2 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Clcc1Q99LI2 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Clcc1Q99LI2 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Clcc1Q99LI2 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Clcc1Q99LI2 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Clcc1Q99LI2 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Clcc1Q99LI2 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Clcc1Q99LI2 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Clcc1Q99LI2 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Clcc1Q99LI2 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Clcc1Q99LI2 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Clcc1Q99LI2 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Clcc1Q99LI2 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Clcc1Q99LI2 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Clcc1Q99LI2 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Clcc1Q99LI2 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Clcc1Q99LI2 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Clcc1Q99LI2 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Clcc1Q99LI2 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Clcc1Q99LI2 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Clcc1Q99LI2 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Clcc1Q99LI2 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Clcc1Q99LI2 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Clcc1Q99LI2 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Clcc1Q99LI2 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Clcc1Q99LI2 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Clcc1Q99LI2 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Clcc1Q99LI2 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Clcc1Q99LI2 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Clcc1Q99LI2 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Clcc1Q99LI2 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Clcc1Q99LI2 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Clcc1Q99LI2 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Clcc1Q99LI2 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Clcc1Q99LI2 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Clcc1Q99LI2 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Clcc1Q99LI2 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Clcc1Q99LI2 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Clcc1Q99LI2 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Clcc1Q99LI2 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Clcc1Q99LI2 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Clcc1Q99LI2 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Clcc1Q99LI2 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
Clcc1Q99LI2 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Clcc1Q99LI2 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Clcc1Q99LI2 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Clcc1Q99LI2 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Clcc1Q99LI2 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Clcc1Q99LI2 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
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